基因组学及基因组工程.pptxVIP

基因组学及基因组工程;§1 基因组学概况 §2 基因组图谱的构建 §3 功能基因组学 §4 主要生物基因组研究进展 §5 基因组工程 §6 生物芯片 ;§1 基因组学概况;人类染色体基因组(核基因组);人类线粒体基因组;基因组学（genomics）;基因组学研究的最终目标;CREDIT: JOE SUTLIFF ;几个代表物种的基因组大小;基因组学的研究内容;结构基因组学（structural genomics）;功能基因组学（functional genomics）;§2 基因组图谱的构建;基因组图谱;遗传图谱（genetic map）;遗传标记（Genetic marker）: 通常将可识别的“等位基因”称为遗传标记；;形态标记;第18页/共126页;第19页/共126页; 最早建立的果蝇连锁图，就是利用控制果蝇眼睛的形状、颜色，躯体的颜色、翅膀的形状等形态性状作为标记，分析它们连锁关系及遗传距离，绘制而成的。 控制性状的其实是基因，所以形态标记实质上就是基因标记。;;果蝇连锁图;细胞学标记;生化标记;DNA分子标记;限制性片段长度多态性（restriction fragment length polymorphism，RFLP）;RFLP分析;RFLP标记位共显性标记;微卫星（microsatellite）标记;不同个体的DNA指纹图谱;利用DNA指纹进行亲子鉴定;利用DNA指纹确定罪犯;遗传图谱的构建方法 ;植物遗传图谱的构建;;选择亲本;构建作图群体 ;群体的类型 1）F2群体;2）BC1群体;3）RIL群体 RIL（recombinant inbred lines，重组近交系）群体是杂交后代经过多代自交而产生的一种作图群体，通常从F2代开始，采用单粒的方法建立。常自交6-7代。;4）DH群体 高等植物的单倍体是含有配子染色体的个体。单倍体经过染色体加倍形成的二倍体称为加倍单倍体或双单倍体。;5）NIL（near-isogenic line ）群体 　　一组遗传背景相同或相近，只在个别区段存在差异的株系，称为近等基因系（Near-isogeneic linesNIL）。 多代回交后自交一次即得回交自交品系。;6） F1群体 　　两个杂合亲本杂交产生的复合杂交群体（ CP群体），拟测交（Pseudo-testcross）群体。;遗传标记的染色体定位;标记间的连锁分析;连锁图谱构建的理论是染色体的交换和重组。;两位点存在连锁(r＜0.5)的概率与不连锁的概率(r=0.5)比;一个位置上所发生的交换会减少其周围另一个单交换的发生。; QTL???位软件 　　 Mapmaker/QTL1.0 　　Map Manager QTX 　　QTL Cartographer 　　Windows Cartographer 　　MapQTL;水稻遗传图;人类遗传图谱的构建;现有的人类遗传图谱;物理图谱的构建;遗传图谱的缺陷;酵母遗传图与物理图比较;物理作图的方法;限制酶作图（restriction mapping）;限制酶作图（restriction mapping）;荧光原位杂交（fluorescent in situ hybridization，FISH）;荧光原位杂交（fluorescent in situ hybridization，FISH）;荧光原位杂交（fluorescent in situ hybridization，FISH）;荧光原位杂交（fluorescent in situ hybridization，FISH）;人类基因组物理图;遗传图与物理图的整合;转录图谱的构建;EST计划的优点;EST计划的不足;基因组测序策略;鸟枪法（shotgun sequencing）;鸟枪法的优缺点;克隆重叠群法（clone contig）;两种基因组测序策略;The E.coli genome;A portion of the E.coli chromosome showing genes and operons. A dot indicates the promoter for each gene or operon. Arrows and color indicate the direction of transcribtion: dark blue genes are transcribed left to right, light blue are transcribed right to left.Overlapping gene are shown in green.; 完成基因组测序，仅仅是基因组计划的第一步，更重要的工作在于弄清楚： ①基因组序列