畜禽分子标记辅助育种技术规程征求意见稿.docx

ICS 07.080A 20/39 ICS 07.080 A 20/39 中华人民共和国国家标准 GB/T╳╳╳╳-201╳ 畜禽分子标记辅助育种技术规程 畜禽分子标记辅助育种技术规程 Code of practice for molecular marker assisted selection breeding of livestock and poultry （征求意见稿） 200×-××-××发布200×-××-××实施 200×-××-××发布 200×-××-××实施 中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局中国国家标准化管理委员会 中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局 中国国家标准化管理委员会 畜禽分子标记辅助育种技术规程 1 范围 本标准规定了畜禽标记辅助选择的基本要求、基因分型、表型测定与采集、单基因或寡基因的标记辅助选择、多基因标记辅助选择的技术内容和要求。 本标准适用于育种单位或委托单位开展猪、鸡、羊、牛等畜禽的标记辅助选择。 2 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件，仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改单）适用于本文件。 NY/T 821 猪肌肉品质测定技术规范 NY/T 822 种猪生产性能测定规程 NY/T 825 瘦肉型猪胴体性状测定技术规范 NY/T 828 肉鸡生产性能测定技术规范 NY/T 1236 绵、山羊生产性能测定技术规范 NY/T 1450 中国荷斯坦牛生产性能测定技术规范 NY/T 1673 畜禽微卫星DNA遗传多样性检测技术规程 NY/T 2123 蛋鸡生产性能测定技术规范 NY/T 2660 肉牛生产性能测定技术规范 农业部2406号公告 转基因动物及其产品成分检测DNA提取和纯化 3 术语与定义 下列术语和定义适用于本文件。 3.1 标记辅助选择 marker assisted selection；MAS 借助分子标记保留有利（理想）基因型个体或淘汰不利（有害）基因型个体，或借助分子标记信息对目标性状的个体育种值开展预测。 3.2 标记辅助BLUP marker assisted best linear unbiased prediction；MA-BLUP 在畜禽个体育种值估计的混合线性模型中加入基于分子标记信息的固定效应或随机效应项，即标记辅助最佳线性无偏预测。 3.3 两阶段选择 two-stage selection 包括标记选择与遗传背景选择两个阶段，第一阶段用直接选择法完成理想基因型的早期选择，第二阶段在中选个体中实施基于传统育种方案的遗传评估。 3.4 分子净值 net molecular score 在合并选择中通过分子标记信息估计的个体育种值的部分，由与目标性状QTL连锁的分子标记效应累加得到。 3.5 选择指数 selection index 分子净值与个体表型值的离差值两部分的加权和。 3.6 寡基因 oligogene 少数几个基因，介于单基因与多基因之间，通常阈性状（如遗传疾病）分为单基因和寡基因两类。 4 基本要求 4.1 标记辅助选择的适用范围和条件应满足以下基本要求： a）已知目标性状的主基因或与之紧密连锁的标记，且分型标记来自于主基因内部或与之紧密连锁的侧翼标记； b）单基因或寡基因的标记辅助选择适用于质量性状、阈性状（如疾病性状）、以及数量性状已知主基因或大效应位点的情形； c）多基因标记辅助选择的适用对象主要为数量性状或多阈性状（如猪的产仔数）； d）多基因标记辅助选择的适用条件：①已知目标性状的若干位点或关联标记；②避免全基因组选择的高通量基因分型，以节约育种成本为目标，只计划利用少量标记； c）分子标记类型一般是单核苷酸多态性。 4.2 标记辅助选择的实施单位或委托单位应具备样品采集、运输、标识和储存、表型测定与采集、基因分型的实验条件和技术人员，确保表型、基因分型数据的完整性和可追溯性。 4.3 标记辅助选择的活动应包括检验（组织或血液样品采样、DNA提取和纯化、DNA定量分析、PCR扩增与PCR产物分型）、有利与有害基因型（或基因型组合）的判定（单基因或寡基因标记辅助选择）、个体育种值/选择指数评估（多基因标记辅助选择）、目标个体的保留与淘汰等环节。 5 基因分型程序 5.1 采样 5.1.1 样品可以是组织样、血液样，也可以是其他生物学样品。 5.1.2 样品采集需要避免个体间DNA交叉污染，每个个体