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金属-内酰胺酶抑制剂的研究进展 1 细菌耐药机制 近年来，细菌对-内酰胺类抗生素的耐药性逐渐成为临床抗感染治疗的主要威胁。其中-内酰胺酶的出现是导致细菌耐药性的主要机制之一。β-内酰胺酶被分为A、B、C、D四类。其中A、C、D类依赖活性位点中的Ser残基发挥水解活性, 而B类依赖活性中心的金属离子, 故被称为金属β-内酰胺酶 (Metallo-β-lactamase, MBL) 虽然越来越多的金属酶抑制剂被报道 2 材料和方法 2.1 肽分子与nd-1的对接 不少含有巯基的化合物已被报道对MBLs有较好的抑制活性, 其中不乏基于氨基酸结构设计的巯基衍生物 然后用分子对接的方法模拟三肽分子与NDM-1的结合模式。对接过程在MOE2014中完成, NDM-1的晶体结构取自PDB数据库 (PDB ID:3Q6X) 。首先对蛋白结构加氢、质子化, 将结构中的原有配体周围口袋定义为活性位点。构建三肽分子并进行结构优化及质子化处理, 对接方法选择Proxy Triangle, 打分函数选择London d G。 2.2 ndm-1金属酶的检测和动力学参数的测量 实验室前期已构建p ET-28a-NDM-1-E.coli BL21 (DE3) 的重组菌株, NDM-1的表达、纯化方法参考文献 2.3 3.3醇对nd-1的抑制作用的测定 2.3.1 酶解时间的确定 在吉尔生化 (上海) 有限公