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- 约 63页
- 2023-08-04 发布于湖北
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李成仁
组织胚胎学教研室
Tel:752220,Email:lichengren@;;一、核酸分子原位杂交的基本概念;(二) 基本原理;;定义:在某些理化因素作用下,DNA双链解开
成两条单链的过程。
方法:过量酸、碱、加热、变性试剂如尿素、
甲酰胺以及某些有机溶剂如乙醇、丙酮等。
;解链曲线; 在适当条件下,变性DNA的两条互补链可恢复双螺旋构象,这一现象称为复性。
热变性的DNA经缓慢冷却后即可复性,又称为退火。;(一)定义:;(二)探针的分类;1. cDNA(complementary DNA);优点:
⑴ 杂交效率比DNA探针高
⑵ 在检测mRNA时所形成的RNA-mRNA杂交体比DNA-mRNA杂交体稳定
缺点:容易受RNA酶的污染而被降解
; 根据靶分子而设计序列在DNA合成仪上合成
优点:形成杂交体快速(序列短,杂交时易于穿透)
缺点:特异性较低(短链和简单);1. 标记物
3H、32P、35S、125I等。
; (2)非放射性标记物
生物素、荧光素、地高辛素、辣根过氧化酶、碱性磷酸酶等。
;;;地高辛标记探针的显色检测 ;Diao HL. 2007. Fertil Steril;2. 标记方法;②随机引物法;(2)RNA探针标记
在体外转录技术中与探针制备同时完成
(3)寡核苷酸探针标记
末端转移法;;原位杂交技术的基本步骤与原理
原位杂交有很多种方法,但其基本实验程序相近的
包括:组织和器材的特殊处理
取材、固定、切片
杂交前处理
探针的制备和预杂交
杂交反应
杂交后处理
检测杂交信号,进行结果分析
;(一)器材的特殊处理;;(1)取材的器具用火焰灼烧过或高温消毒
(2)标本尽早固定,固定剂可灭活部分RNA酶
(3)所用玻璃器皿均须DEPC水浸泡(37 ℃,2h),蒸馏水清洗后高压消毒,然后180℃处理3h以上
(4)塑料器材最好用灭菌的一次性用品或DEPC处理
整个操作过程带手套和口罩。;;所使用的容器、刀具等均经高压消毒或清洁后用DEPC水清洗。
为防止RNA迅速降解,标本离体切小,迅速投入4% 多聚甲醛溶液内,置4℃冰箱内2-4小时。
再将组织移入30%蔗糖PBS溶液内,4℃冰箱内过夜。
次日可将标本储存于-80℃ 低温冰箱内保存。
;组织制???
冷冻切片以厚5~30um最佳。
40℃烤箱内干燥2小时后储存在-80℃超低温冰箱
在-20℃可保存2~3周,在-70℃可保存数月之久
石蜡切片,一般不提倡浸入二甲苯溶液。;(三)杂交预处理; 2.增强标本通透性与核酸探针穿透性
常用方法:蛋白酶消化、去污剂处理、酸酐处理和稀酸洗涤等
(1)蛋白酶K(甘氨酸)、胃蛋白酶(4%多聚甲醛后固定)
酶的浓度和孵育时间应视标本种类、固定剂种类、切片厚度等而确定; (2)去污剂处理
Triton X-100最常用
注意:去污剂处理不当,会引起靶核苷酸的丢失,影响标本的形态结构
(3)酸酐处理和稀酸洗涤
防止探针与标本内的碱性蛋白发生静电效应,减少杂交反应的背景色;3. 预杂交
杂交之前使用不含核苷酸探针的杂交液在杂交温度下预先孵育切片,以达到封闭或阻断与核苷酸探针产生非特异性杂交点,降低背景着色的目的。; 标记的探针与检测标本上的靶序列结合而形成杂交体的过程。
这是原位杂交技术的关键步骤。
包括:探针的准备
双链核酸的变性
杂交反应;探针长度:50-100个碱基最佳
探针标记物:地高辛(DIG)
探针浓度:0.5-5.0μg/ml;
杂交液的量要适当,以10~20μl/每张切片为宜 ;理论热变性温度:90℃-95 ℃
甲酰胺法:常规的加入30~50%甲酰胺于杂交液中
每增加1%,Tm值降低0.72℃,降至37-40 ℃为宜
注意:在每次变性后,都需要将样品用冰迅速冷却,以保持变性后单链状态。;探针——预变性的探针
高浓度盐类(柠檬酸钠)——增加杂交体的稳定性
甲酰胺——可降低解链温度
硫酸葡聚糖——对DNA有浓缩作用,可提高杂交的反应速度10倍以上,但不影响探针的洗脱强度
牛血清白蛋白和鲑鱼精DNA或RNA——用于阻止探针与非特异位点或非目标DNA杂交。;方法:杂交液滴于切片上,加盖硅化的盖玻片。
杂交的温度:在Tm-25℃
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