4种软件使用说明-研究生课程.pptVIP

下载本文档

0
0
约1.34千字
约 14页
2023-08-25 发布于四川
举报
版权申诉

4种软件使用说明-研究生课程.ppt

1、本文档共14页，可阅读全部内容。
2、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。
3、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击这里二次下载。
4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
5、该文档为VIP文档，如果想要下载，成为VIP会员后，下载免费。
6、成为VIP后，下载本文档将扣除1次下载权益。下载后，不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
7、成为VIP后，您将拥有八大权益，权益包括：VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
8、VIP文档为合作方或网友上传，每下载1次，网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等，对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档

遗传多样性分析—— NTSYS2.10 1、利用Quantity One读带，有带记录为1，无带记录为02、数据准备：生成0-1矩阵Example：60份荔枝龙眼材料的0-1矩阵3、利用NTsys2.10进行分析：相似性系数分析：Similarity —— Qualitative data聚类分析：Clustering —— SAHN生成树状图：Graphics —— Tree plot 遗传连锁图谱的构建—— JOINMAP3.0 MAPCHART 1、数据准备Example：荔枝MS群体图谱数据（1）txt文本的题头格式为： name ＝名称 popt = population type codes (如CP) nloc=the numbers of loci nind=the numbers of individuals （2）位点的分离类型作图群体在引物MG-AC-21上的分离情况（ab×bc），M为20bp ladder marker作图群体在引物MG-AC-85上的分离情况（aa×b0），M为20bp ladder marker 作图群体在引物MG-AG-222上的分离情况（ab×ab），M为20bp ladder marker作图群体在引物MG-AC-203上的分离情况（a0×b0， a0×00 ），M为20bp ladder marker 2、利用JoinMap3.0 进行连锁分析新建文件：File —— New Project数据转换：File —— Prepare Data：*.loc数据载入：File —— Load Data位点分群：LOD groupings（tree）—— Calculate连锁分析：Population —— Creat group for mapping — — Calculate map 3、收集*.map文件，利用MapChart构建图谱Example：（1）单个连锁群（2）连锁群配对 QTL分析—— MAPQTL5.0 MAPCHART 1、数据准备：*.loc，*.map，*.quaExample：MS群体.loc MS群体.map 12个荔枝性状数据.qua 2、利用MapQTL5.0进行数据分析新建文件：File —— New Project数据载入：File —— Load Data数据分析：Interval Mapping —— Calculate数据整理：选取LOD3.0 的位点 Example：MS群体QTLs数据 3、利用MapChart进行作图Example：MS群体QTL Thanks for your attention！