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PubMed使用手册
一、PubMed简介:
PubMed是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的查询系统,是NCBI的Entrez系统的数据库之一。该系统通过网络途径免费提供包括MEDLINE在内的70多外国家4800多种主要生物医学文献的书目索引文摘数据库,并提供部分免费和付费的全文链接服务。
二、页面介绍:
登录/entrez/ query.fcgi后,你将进入Pubmed的主页面。如图:
主页面左侧框的介绍:
1) MeSH Database你可以用它来分层流览MesH表
2) Single Citation Matcher通过填表的形式输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。
3) Batch Citution Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。
4) Clinical Queries这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围:治疗、诊断、病原学与预后。
5) Related Resources
Order Documents提供一种收费性质服务,可以使用户在当地得到文献的全文拷贝(费用与发送方式各不相同)。
Consumer Health提供与MEDLINEplus的链接,MEDLINEplus是与消费者健康信息相关的国家医学图书馆的网络节点。
Clinical Alerts此部分的目的是加快NIH资助的临床研究成果的发布。
三、检索方法:
1.PubMed基本检索方式(Basic PubMed Search)
进入PubMed基本检索方式主页,在检索框中可以输入任意词,包括文献作者,出版杂志等:
键入一个或多个检索词(可以为任意词),如protein disulfide isomerase ,也可以输入缩略名如pdi等;输入多个词时,可自动识别成词组;但词数太多时,则以逻辑与的方式识别,如可以将protein disulfide isomerase识别成一个词,也有可能将其识别成“protein AND disulfide AND isomerase”尤其是出现数字等符号时不易识别成词组;
对PubMed不能识别检索的词组,需加引号强调,如键入:“Insight II”
以文献作者方式检索,作者名的输入格式为: 姓+名。如输入:Freesman DJ,其中“姓”为全称,“名”则为首字母简写形式;
键入的杂志名称可以是全名,也可以是杂志名的MEDLINE缩写格式,或ISSN杂志号。
检索时可在词尾加“*”号检索所有具有同样词头的词。如键入:“biolog*”可查得biology或biological等词。
词与词间可用AND、OR或NOT逻辑进行连词检索。
键入检索词后,别忘了选择检索年限(30天,10年不等)及选择文献的页面显示数目。
2.PubMed高级检索方式 (Advanced Search)
高级检索方式增加了检索范围(search fields)和检索模式(search mode)的选择框。
1)在检索范围 Search Fields 选择条框中,包含了:
·All fields[ALL],指PubMed所有检索范围;
·Affiliation[AD,AFFL],指联系地址,包含第一作者或其他作者联系地址;
·Author Name[AU,AUTH],包含文章的所有作者,格式为“姓+名(首字母大写)”;
·E.C. Number[RN,ECNO],指酶学委员会统一规定的对每一个酶的特定的编号,同时也包括CAS登记号;
·Journal Title[TA,JOUR] 指期刊的名称;
·Language [LA,LANG]指文献语种;
·MeSH Major Topic[MAJR] 包含MEDLINE检索系统认为最重要的MeSH医学主题词表;
·MeSH Terms[MH,MESH], 包含所有用来检索MELINE的医学主题词(Medical Subject Headings);
·Modification Date[MDAT],指文献收入PubMed的日期(年-月-日,如97-Jul-26);
·Page Number[PAGE]指文献在杂志中的起始页;
·Publication Date[DP,PDAT],指文章出版日期;
·Substance[NM,SUBS],指与文献相关的化学物质在化学文摘服务社(Chemical Abstract Service, CAS)中登记的名字和在MEDLINE中的物质名称;
·Text words[TW,WORD],包括文章标题目,摘要中出现的所有述词以及MeSH词表和化学物质名称中的个别词;
·Title words[TI,TITL],仅包括文献记
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