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鱼肉中大肠杆菌的分离与鉴定
实验报告
一、实验目的
1.学习大肠杆菌的鉴定方法。通过选取培养好的菌群,并通过PCR扩增以及凝胶成像技术鉴定大肠杆菌。
2.学习PCR的原理及技术
二、实验原理
1.大肠杆菌(E.coli)为埃希氏菌属(Escherichia)代表菌。一般多不致病,为人和动物肠道中的常居菌,在一定条件下可引起肠道外感染。某些血清型菌株的致病性强,引起腹泻,统称致病性大肠杆菌。
2.大肠杆菌(Escherichia coli,E.coli)革兰氏阴性短杆菌,大小0. 5x1-3微米。周生鞭毛,能运动,无芽孢。能发酵多种糖类产酸、产气是人和动物肠道中的正常栖居菌,婴儿出生后即随哺乳进入肠道,与人终身相伴,几乎占粪便干重的1/3.国家规定,每毫升饮用水中的菌落总数小于100,每100毫升水中不得检出总大肠菌群
3.PCR扩增技术是指在体外简化条件下模拟DNA体内复制的DNA快速扩增的方法。本实验通过大肠杆菌特定引物对菌种DNA进行PCR扩增,之后凝胶成像鉴定样品中的菌种是否是大肠杆菌。
三、实验流程
(1)超净工作台无菌操作
(2)灭菌
(3)麦康凯培养基的制备与灭菌
(4)培养皿的制备
(5)称量鱼肉
(6)均质
(7)梯度稀释
(8)涂培养皿
(9)挑取单菌落
(10)提取DNA(水煮法)
(11)PCR扩增
(12)凝胶电泳
(13)紫外显影
实验方法
CTAB/NaCI法:
1、接种一单菌落于5mlLB中,30℃培养过夜。
2、取1ml种子培养液接入100ml2%LB中.37℃、220r/min培养16小时。
3、5000r/min离心10分钟,弃去上清。
4、加入10mITE离心洗涤后,用10mITE溶解菌体,混匀,-20℃保存备用。
5、取3. 5ml菌悬液,加入184μl10%SDS.混匀,加入37μl10mg/ml蛋白酶K.混匀,37℃温育1小时
6、加入740μl5mol/LNaCl,再加入512μICTAB/NaCl.混匀,65℃温育10分钟。
7、加入等体积的氯仿/异戊醇,混匀.10000r/min离心5分钟,保留上清。
8、上清中加入等体积的酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)混匀.10000r/min离心5分钟,保留上清。
9、加入0. 6倍的异丙醇,混匀,10000r/min离心5分钟,收NA沉淀,用70%乙醇离心洗涤DNA沉淀。
10、用1mITE溶解DNA,加入终浓度为20μg/mlRNaseA.4℃保存。CTAB/NaCI法提取的DNA纯度较高,蛋白杂质较少,保存时间长,编者更喜欢把终浓度为20μg/ml RnaseA加在第5步温育的时候,这样最后没有RnaseA污染。每一步操作细致一些,得到的DNA可用于Southern blot.编者建议:长时间保存DNA可放于-20℃,但要尽量减少反复冻融,否则影响DNA质量。
五、实验步骤
(1)超净工作台无菌操作
1:打开超净台紫外灭菌灯开关。
2:关闭超净台紫外灭菌灯开关。
3:打开超净台荧光灯开关。
4:打开超净台风扇开关。
5:抬起玻璃门。
6:用75%酒精消毒。
7:夹取酒精棉。
8:擦拭超净台台面。
9:关闭超净台荧光灯。
10:关闭超净台风机。
(2)灭菌
1:打开电子天平开关。
2:将称量纸放于天平托盘上。
3:点击清零键。
4:取固体蛋白胨粉末。
5:放于称量纸上。
6:称量好的蛋白胨粉末放于500mL三角瓶中。
7:用200mL量筒量取200mL去离子水。
8:将去离子水倒入三角瓶中。
9:用50mL量筒量取25mL去离子水。
10:将去离子水倒入三角瓶中。
11:使用透气封口膜封住三角瓶。
12:灭菌胶带上标明试剂名称、组别和日期。
13:点击清零键清零。
14:取TSB粉末。
15:放于称量纸上。
16:称量好的TSB粉末放于300mL烧杯中。
17:用200mL量筒量取160mL去离子水。
18:将去离子水倒入烧杯中。
19:将烧杯放于电加热版上。
20:打开电加热板开关。
21:调节温度至100摄氏度。
22:点击Set开始升温。
23:关闭加热板。
24:取下烧杯。
25:确认5mL移液器量程为5mL。
26:移液枪吸取5mLTSB溶液。
27:TSB溶液放于试管1中。
28:移液枪再次吸取5mLTSB溶液。
29:TSB溶液放于试管1中。
30:扔掉枪头。
31:用灭菌胶带在试管架上注明信息。
32:取50mL去离子水。
33:将去离子水倒入50mL蓝盖试剂瓶中。
34:输入去离子水瓶信息。
35:将所用到的50mL烧杯等放入灭菌袋1中。
36:在灭菌袋上注明信息。
37:将所用到的涂布棒物品放入灭菌袋2中。
38:在灭菌袋上注明信息。
39:将所用到的枪头盒放入灭菌袋3中。
40:在灭菌袋上注明信息。
41:将所
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