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肿瘤事业部——生物信息工程师工作职责
作为肿瘤事业部的生物信息工程师,工作职责主要涉及以下几个方面。
一、序列数据分析
生物信息学成为了现代医药研究的必备工具,其中一项核心技术就是对生物序列数据进行分析。生物信息工程师需要熟练地使用生物信息学软件(如BLAST、Bowtie、GATK等)对基因组、转录组和蛋白质组等序列数据进行分析和挖掘,以探寻肿瘤的遗传变异和转录变化等信息,为进一步的研究奠定基础。
二、表达谱数据分析
表达谱是一种研究基因转录的手段,它可以反映不同组织或个体在基因表达水平上的差异。生物信息工程师需要掌握表达谱数据处理的方法(如标准化、差异分析、聚类分析等),并运用基于统计学和机器学习的方法对表达谱数据进行解析,研究肿瘤样本中的基因表达谱差异、基因水平的变异和表达调控机制等,为肿瘤研究提供新视角和研究思路。
三、生物网络分析
生物网络分析是用于研究生物分子相互作用的一种分析方法,例如蛋白质相互作用网络或代谢网络。在肿瘤事业部中,生物信息工程师常常需要构建、分析和可视化基于转录因子、miRNA、代谢物和蛋白质等生物分子的网络,以深入了解肿瘤生物学中的调控网络和信号通路,发掘潜在的肿瘤治疗靶点。
四、工作流搭建与管理
生物信息学会涉及到大量的数据处理、分析和结果解释,在这个过程中,生物信息工程师需要设计和建立合适的工作流,保证整个数据分析流程的正确性和可重复性。同时,生物信息工程师还需管理和维护分析流程中使用的软件和工具,保证数据分析工作能够持续、高效地进行。
以上是肿瘤事业部生物信息工程师的主要工作职责。随着生物学和信息学的不断发展,生物信息工程师在肿瘤研究中的角色将越来越重要,相信在不久的将来,生物信息工程师将成为肿瘤治疗研究的重要组成部分。
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