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Tm 值就是DNA 熔解温度,指把 DNA 的双螺旋结构降解一半时的温度。不同序列的 DNA, Tm 值不同。DNA 中 G-C 含量越高,Tm 值越高,成正比关系。Tm 是PCR 引物设计中一个非常重要的参数.是指引物与模板之间精确互补并且在模板过量的情况下有50% 的引物
计算方法核酸Tm 值(解链温度)计算评价标准是核酸所吸收的光线量达到其所增加吸收260nm 光线的量的两倍达到的温度, 当核酸达到Tm 值时,其 260nm 吸收量可增加百分之四十(紫外吸收量随解体程度而增加,直至完全解体。长度为 25mer 以下的引物,Tm 计算公式为:Tm = 4℃(G + C)+ 2℃(A + T)对于更长的寡聚核苷酸,Tm
计算方法
核酸Tm 值(解链温度)计算
评价标准是核酸所吸收的光线量达到其所增加吸收260nm 光线的量的两倍达到的温度, 当核酸达到Tm 值时,其 260nm 吸收量可增加百分之四十(紫外吸收量随解体程度而增加,直至完全解体。
长度为 25mer 以下的引物,Tm 计算公式为:Tm = 4℃(G + C)+ 2℃(A + T)
对于更长的寡聚核苷酸,Tm 计算公式为:
Tm = 81.5 + 16.6 x Log10[Na+] + 0.41 (%GC) –600/size
公式中,Size = 引物长度影响 Tm 值的因素:
①DNA 碱基组成:C-G 含量越多,Tm 值越高;A-T 含量越多,Tm 值越低。
②溶液的离子强度:在低离子强度中,Tm 较低,而且解链的温度范围较宽;在高离子强度中,Tm 值较高,解链的温度范围较窄。
③PH 值:溶液的PH 值在 5~9 范围内,Tm 值变化不明显,当PH11 或 PH4 时,Tm 值变化明显。
④变性剂:各种变性剂主要是干扰碱基堆积力和氢键的形成而降低Tm 值。
⑤DNA 双链本身的长度。
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