肾透明细胞癌及癌旁组织转录组差异表达的初步分析的中期报告.docx

肾透明细胞癌及癌旁组织转录组差异表达的初步分析的中期报告 本文的中期报告主要介绍了对肾透明细胞癌及癌旁组织的转录组数据分析的初步结果。 首先，我们从TCGA数据库中获取了58个肾透明细胞癌及其相应的癌旁组织样本的RNA测序数据。使用DESeq2软件对数据进行差异表达分析，发现共有7157个基因在肾透明细胞癌组织与癌旁组织之间存在显著差异表达。其中，3120个基因表达上调，4037个基因表达下调。使用GO和KEGG功能富集分析对差异表达基因进行功能注释，发现这些基因主要与肿瘤发生、代谢、信号转导等相关。 然后，我们进一步分析了某些在肾透明细胞癌组织中显著上调或下调的基因，并进行了相关的验证。例如，我们发现在肾透明细胞癌组织中表达上调的基因DLGAP5和KIF20A，根据文献报道与肿瘤恶性程度和预后有明显关系。我们使用qRT-PCR技术对这两个基因在临床样本中的表达进行验证，发现它们在肾透明细胞癌组织中的表达确实显著上调。 综上所述，我们对肾透明细胞癌及其相应的癌旁组织的转录组数据进行了初步分析，并发现了许多与肿瘤发生和发展相关的差异表达基因。接下来，我们将进一步研究这些基因的功能和其在肾透明细胞癌发生中的作用。