合成生物学-改变世界的钥匙 .pdfVIP

合成生物学-改变世界的钥匙 万物生长背后有自然运行的法则。相对对广袤天地，芸芸万物， 人类渺小而历史短暂。我们不是造物主，但依靠科学技术的力量，我 们有了不断改造环境、改善生活的能力，人类社会的发展也正是这样 一部壮丽的史诗。而合成生物学，是新世纪人类窥自然秘密之一斑后 与自然博弈的又一把钥匙。设计生命、合成生命的技术为人类更好得 了解、适应和改善自然打开一扇新的窗户，让我们得以探头，遥望美 丽新世界。 天空中的飞鸟、陆地上的走兽、碧海里的游鱼、色彩斑斓的花草 树木……，不同的生命形式组成了多姿多彩、生机勃勃的大自然。鸟的 下一代之所以是鸟而不会是鱼，是由于在每个生命体内都存在着一种 叫做“DNA”的遗传物质 ，DNA 决定了生命的呈现方式，会随着物种 延续而传递到子代，这就从生物学的角度解释了 “有其父必有其子” 的必然性。从沃森和克里克发现 DNA 双螺旋结构到二十世纪三大科学 计划之一的人类基因组计划完成，人们对生命本质的了解进入了新的 纪元。 分子生物学、基因工程以及测序等生物技术 日新月异的发展，使 得人类开始了解 DNA 如何促使生物细胞发挥功能，并且逐渐通过改造 基因 ，让 自然界的生物为人类的健康生活所需的物质、环境 “添砖加 瓦”。然而科学家在对 DNA 的功能研究过程中，发现生物系统太过复 杂 ，严重阻碍了对系统的全面透彻理解及后续的应用。21 世纪初 ，科 学家从工程学的角度出发，探索一种新的针对 DNA 可以像搭积木一样 标准化操作的生物技术，由此产生了一个新的科学领域——合成生物 学（synthetic biology ）。 一、缘 起 “合成生物学”一词首次出现在 1911 年的 《Science》杂志 ，但 直到 2000 年才开始在国际科研界渐渐传开。2010 年横空出世的人造 生命“Synthia”（首个完全人工合成的支原体生命），将名不见经传 的合成生物学摆在聚光灯下。虽然引起了巨大争议，但也因此迅速成 为全世界新的科学研究热点，潜在的应用价值促使预言家认为其将催 生下一次生物经济浪潮。 发展神速的合成生物学究竟是什么？学界众说纷纭，目前为止还 没有一个统一的定义。由众多研究室组成的“合成生物学国际联盟组 织”( )给出的释义是：（1 ）设计和构建新的生物功能元件、装置和系 统；（2 ）根据特定的目的，重新设计已有的天然生物系统。通俗来讲 ， 就是将工程化理念运用到生物学研究中 ，人为地将 DNA 按功能区分 （如启动子、终止子等等 ），如同电脑部件（如 CPU、硬盘、风扇等 ） 一样将其设计改造成具有标准接口的 DNA 片段 ，称之为标准化的功能 元件；按照最终要达到的目标 ，选择适宜的功能元件，像组装电脑一 样组装成生物装置或系统（生物系统要比生物装置更为复杂 ），再转 入细胞后行使特定的功能。由此可见，通过合成生物学，既能设计改 造已有天然生物系统，又能从头合成全新的系统，进一步强化了生物 系统的可塑性 ，拓展了应用范围。 事实上 ，现阶段以计算机、数学、分子生物学、系统生物学等众 多学科为基础的合成生物学，经常被与较为成熟的基因工程混淆。合 成生物学重在设计、从头合成，操作范围广。典型的例子是首个人工 生命“Synthia”，科学家以蕈状支原体基因组为模板 ，重新设计并组 装了基因组序列 （缩短至 108 万个碱基对 ），移植到山羊支原体细菌 空壳内 （细菌本身基因组被移除 ），得到具有生命活性的“Synthia”。 有趣的是，参与人员的姓名和不少名言都以 “水印”序列的方式留在 了“Synthia”的基因组中 ，颇具艺术气质。而基因工程是人为改变生 物基因组序列最为常用的一种方式 ，由此赋予它们更优良的特性满足 人类的需求 ，例如 “转基因”。基因工程只能针对几个基因去操作 ， 转基因的抗虫棉依然是棉花 ，并没有改变物种本身。如果将生物体比 喻成一台复杂的电脑 ，那么基因组可以认为是这台电脑的操作系统。 合成生物学给山羊支原体细菌重构了操作系统而成为“Synthia”，跨 越了物种的界限，如果换成基因工程却只能更换其中数个软件。 合成生物学与基因工程对