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斑点叉尾鮰miRNA系统鉴定与表达特征分析的中期报告 本项目旨在对斑点叉尾鮰（Kryptopterus bicirrhis）的miRNA系统进行鉴定和表达特征分析。在中期阶段，我们完成了以下工作： 1. 文献综述 对斑点叉尾鮰miRNA研究相关文献进行了综述和梳理，对其基本生物学特征和miRNA鉴定、表达调控等方面的知识做了系统性的了解和总结，为后续的研究提供了重要的参考。 2. 基因组筛选预测 利用生物信息学方法，在斑点叉尾鮰基因组序列中筛选出可能编码miRNA的序列，预测出了大约400个候选的miRNA基因，进一步对这些候选基因进行生物信息学分析和比对，并选择出最有可能为斑点叉尾鮰miRNA的候选序列。 3. RNA提取及miRNA文库构建 从斑点叉尾鮰不同部位的组织中提取总RNA，并使用聚合酶链式反应（PCR）技术合成了小RNA文库。经过高通量测序后，得到了大量的小RNA序列数据，为后续的miRNA鉴定和表达调控研究提供了重要的数据支持。 4. miRNA鉴定与序列分析 利用高通量测序数据对斑点叉尾鮰miRNA进行鉴定和序列分析，初步得到了大约300个miRNA序列，并对这些序列进行了系统性分析和比对。同时，结合miRBase数据库的信息，对得到的miRNA序列进行了注释和分类，为进一步的表达调控研究提供了基础。 5. miRNA表达分析及差异分析 利用高通量测序数据，计算并比较了不同组织和不同发育阶段中miRNA的表达量，并通过差异分析方法筛选出了关键的表达调控miRNA，为后续的功能研究提供了重要的线索和方向。 总的来说，在中期阶段，我们已经完成了对斑点叉尾鮰miRNA系统的鉴定和表达特征分析的初步工作，为进一步的研究打下了坚实的基础。随着后续实验和数据分析的进行，我们将深入探索斑点叉尾鮰miRNA的功能及其调控机制，为揭示其生物学及进化特征提供更深入的理解和认识。