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动植物动植物基因组基因组项目项目及技术及技术进展进展 动植物动植物基因组基因组项目项目及及技术技术进展进展 2011 年德国爆发急性肠出血性流行病疫情——极大困扰着英国剑桥市新 生儿护理病房的医护人员。来自 Sanger 研究院的研究人员从多个患者身上取样， 并采用 Illumina MiSeq 进行全基因组测序。通过生物信息学分析得知，在疫情爆 发过程中发生了一系列小规模突变，流行病学家据此绘制出一个进化树，追踪疫 情逐步靠近可疑的源头。文章作者 Julian Parkhill 表示：“基因测序提供了明晰的 线索，这是其他方法难以做到的。”文章发表在流行病学顶级杂志 The Lancet Infectious Diseases。 2012 年发表在 science 杂志旗下 Science Translational Medicine 另外一篇 文章也同样表明了全基因组测序技术在流行病学中重要作用。位于马里兰州贝塞 斯达市医疗中心出现了严重的血液传染病事件，在此次事件中，共有 17 名病人 感染了血液传染病，并造成 6 人死亡。来自美国 NIH 人类基因组研究所的研究 人员从病人体内和医院一些设备上采集了细菌样本，并对不同菌株的基因组进行 测序。通过对突变菌株进行聚类分析，将病人分组，再结合病例住院的记录（入 院时间、所在病房等）画出了最可能的传播路线。 全基因组测序提供的详尽细节让传染病学家们真正地理解了疾病传播途 径，详尽的追踪技术将带来更加完善的公共健康领域内的传染病学研究。所以流 行病学家更有可能找到事件发生的真正原因，而非最简单的原因。这两件事让我 们真实的看到了全基因组测序在流行病学的重要作用。 事实上，媲美曼哈顿和登月计划的“人类基因组计划”所带来的巨大作用正在 逐渐显现，高通量测序技术走向个性化医疗已是大势所趋。全基因组测序使得生 命可以测量，人们可以更加方便快捷的了解生命的奥秘。 目前已发表基因组序列的物种如下，对于进一步解析其生命活动提供了极 大帮助。 植物基因组植物基因组 植物基因组植物基因组 植物基因组植物基因组 植物基因组植物基因组 中文名 中文名 发表时间 发表时间 刊物 刊物 基因组大小 基因组大小 中文名中文名 发表时间发表时间 刊物刊物 基因组大小基因组大小 拟南芥 2000.12 Nature 125Mb 水稻 2002.04 Science 466Mb 水稻 2002.04 Science 467Mb 杨树 2006.09 Science 480Mb 葡萄 2007.09 Nature 490Mb 衣藻 2007.01 Science 130 Mb 小立碗藓 2008.01 Science 480Mb 番木瓜 2008.04 Nature 370Mb 三角褐指藻 2008.11 Nature 27.4Mb 高粱 2009.01 Nature 730Mb 玉米 2009.11 Science