生物信息学(李霞)第章.pptVIP

一、PIR数据库 蛋白质信息库（PIR）（）是一个支持基因组学、蛋白质组学和系统生物学检索和科学研究的综合公共生物信息学资源。 PIR是由美国国家生物医学基金会（NBRF）于1984年建立，帮助研究者确认和解释蛋白序列信息的数据库。 PIR免费为科学界提供包括蛋白序列数据库（PSD）在内的蛋白数据库和分析工具。 本文档共62页；当前第31页；编辑于星期二\3点5分 PIR信息库资源 本文档共62页；当前第32页；编辑于星期二\3点5分 PIR主要数据库： 1. UniProt-通用蛋白质资源库 2. iProClass-蛋白质知识整合数据库 3. PIRSF-蛋白质家族分类系统 4. iProLINK-蛋白质文献、信息和知识整合数据库 本文档共62页；当前第33页；编辑于星期二\3点5分 1.UniProt-通用蛋白质资源库 UniProt（）是存储和链接其他蛋白质数据库的资源库，并且是蛋白质序列和具有综合功能注释目录的中心资源库。使用UniprotKB可以检索准确、可靠的蛋白综合信息。使用UniRef可以减少冗余，加速序列相似性搜索。使用UniParc可以检索存档序列和它们来源的数据库。 本文档共62页；当前第34页；编辑于星期二\3点5分 2. iProClass-蛋白质知识整合数据库 iProClass（）提供来自90多个生物学数据库的大量整合数据，包括蛋