改善RNA提取质量的十点建议.docxVIP

一些经验，现在拿出来和大家分享一下！?希望对大家有用！?感觉不错的评价顶一下哦！? 收获组织及细胞死亡之后，应立即灭活内源的RNA酶，以防止RNA降解。 以下3个方法均可有效使内源RNA酶失活： 1） 用含离液（如胍盐）的细胞裂解液收获样品，并立即匀浆。 2） 用液氮瞬间冻结样品。值得特别注意的是：组织块必须保证足够小，在浸入液氮的瞬 间就能冻结，以确保瞬间令RNA酶失活 3） 立即将样品置于 RNAlater? Tissue Collection: RNA Stabilization S olution 中。它是一种 水相、无毒的收集试剂，能立即稳定并保护完整、未冻结的组织和细胞样品中的RNA。关 键要点是组织样品切片一定要够薄（＜0.5 cm），这样RNAlater才能在RNase破坏RNA之前 迅速渗入组织块中。 使用正确的细胞或组织储存条件 在样品用液氮瞬间冻结之后，应该储存在-80°C，千万不能解冻。即使是置于含有胍盐的 裂解液中作匀浆前的短暂解冻，也会导致RNA的降解和损失。瞬间冻结的组织应该首先在 超低温条件下先研磨成粉，然后置于裂解液中进行匀浆。 RNAlater使样品储存更为便利。储存在RNAlater中的细胞或组织可在室温下稳定保存长 达1个星期，在4°C可稳定保存长达1个月，或永久保存在-20°C。 彻底匀浆样品 细胞或组织的彻底匀浆对RNA提取来说，是一个很关键的步骤，它能够防止RNA的损 失和降解。匀浆的方法应根据细胞或组织的类型来选择。大部分培养的细胞可以置于细胞裂 解液中，通过简单的涡旋震荡来匀浆；而动物组织、植物组织、酵母和细菌则常常需要更加 剧烈的方法。比如说细菌的细胞壁，就需要酶消化来实现彻底的细胞裂解和RNA的最大回 收。 在RNA提取之前预处理样品裂解液 对于某些样品来说，在匀浆之后，RNA提取之前，还需要一些额外的处理步骤。对于脂 肪含量高的组织，像脑组织和脂肪组织得到的裂解液，就需要通过氯仿抽提来去除脂类，从 而提高RNA产量。许多植物组织中富含多酚和多糖，会降低RNA的质量和产量，用Plant RNA Isolation Aid预处理裂解液可去除这些难以处理的成分。 5.选择最好的RNA分离方法 现有众多的RNA分离方法也许令人难以取舍。目前最简单也是最安全的方法是柱式分 离，如RNAqueous?或RNAqueous-4PCR Kit。因为操作简单，所以这些步骤特别适用于 同时处理多个样品。如果是处理复杂的组织，如富含核酸酶（胰腺）或脂肪（脑和脂肪组织） 的样品，就推荐使用更加严格的、基于酚处理的RNA分离方法，如ToTALIY RNA?0 DNase 处理 如果提取的RNA将用于RT-PCR,我们推荐用DNase处理纯化的RNA样品以去除残留 的DNA污染。当样品来源于富含DNA的组织，如脾脏时，DNase处理也是一个好办法。 Ambion的RNAqueous-4PCR Kit的实验流程中包含了 DNase处理的步骤，并提供了必需的 试剂（DNA 酶 I）。DNA-freeTM DNase treatment Removal Reagents 则可用于去除用各种方 法制备的RNA样品中的DNA污染。这两个产品都提供了高质量的DNase I，优化的反应缓 冲液，和DNA酶消化处理后简单快速去除DNase的方法，无需使用有机溶剂和热处理。 减少环境RNase的暴露 为了得到完整的、高品质RNA，在整个RNA制备过程中，当RNA离开强蛋白变性剂 （如离液裂解液或酚）的保护时，避免引入新的RNase污染就非常关键。由于RNase几乎 是无所不在，所以必须确保与纯化的RNA接触的每一样东西都是无RNase污染的。所有的 表面，包括移液器、工作台、玻璃器皿和制胶设备，都必须用表面去污净化溶液如RNaseZap? 或RNaseZap Wipes来处理过。必须保证一直使用无RNase的枪头、试管和溶液，手套也应 经常更换。 正确的沉淀 纯化得到的RNA可能需要通过沉淀来浓缩，以满足一些下游应用的需要。醋酸铵 （NH4OAc）沉淀（加0.1体积的5 M醋酸铵、2-2.5体积的无水乙醇，-20°C放置25分钟以 上）可以很好地回收RNA。如果需要定量回收低浓度的RNA（ng/ml），可以采用共沉淀（如 糖原 glycogen,、酵母 yeast RNA 或 linear acrylamide）的方法。当 RNA 用于 RT-PCR分析时， 线性的丙烯酰胺和DNase处理的糖原都可以作为理想的共沉淀剂，因为它们都不含DNA污 染。酵母RNA和未处理的糖原会给样品带来核酸污染，有可能影响RT-PCR的结果。沉淀 后，注意避免RNA沉淀过分干燥，因为这可能导致很难重新溶解。 重悬 许多RNA提取步骤的