基于高通量测序鉴定金煌杧软鼻病相关致病基因的研究的中期报告.docxVIP

基于高通量测序鉴定金煌杧软鼻病相关致病基因的研究的中期报告 本研究旨在通过高通量测序技术，鉴定金煌杧软鼻病的相关致病基因。目前已经完成实验样本的采集和处理，并通过Illumina HiSeq X Ten平台进行了转录组测序和基因组测序。以下是中期研究结果的概述。 1. 样本采集和处理 我们从两个金煌杧（Lithocarpus litseifolius）种群中选择了50个健康个体和50个患有软鼻病的个体进行研究。样本采集和处理过程中，我们严格按照标准化的操作流程进行，并在纯化DNA和RNA的过程中使用了高品质试剂和仪器。 2. 转录组测序 我们将50个健康个体和50个患有软鼻病的个体的RNA样本分别用于转录组测序，得到了大量的高质量测序数据。将这些数据与金煌杧的基因组进行比对，我们能够鉴定出大量的差异表达基因，即在软鼻病患者中表达水平显著高于或低于健康个体的基因。这些差异表达基因能够为进一步鉴定致病基因提供重要线索。 3. 基因组测序 我们还对金煌杧的基因组进行了测序，并生成了高质量的基因组参考序列。通过基因组测序，我们能够鉴定出大量的潜在致病基因，在这些基因中，我们发现了许多与免疫反应、细胞凋亡、氧化应激等病理生理过程相关的基因。这些基因的突变可能会导致机体的免疫系统发生异常，从而引发软鼻病等疾病。 4. 进一步分析 在接下来的研究中，我们将进一步对以上测序数据进行分析，利用生物信息学方法和功能注释分析工具，筛选出具有高度可能性的致病基因，并针对这些基因进行深入研究。同时，我们还将探究这些基因参与的分子机制和信号通路，在深层次上了解软鼻病的发病机制。