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文献检索 科目：生物信息学 专业：生物工程 班级：xxxxxx 姓名：xxx 学号：xxxxxxxxxxxxxx 目录： 1. 生物信息学的简介； 2. 生物信息学的产生和发展； 3. 生物信息学的主要研究内容 4. 生物信息数据库 5. 生物信息学的现状及展望 6. 参考文献 摘要：本文阐述了生物信息学的产生和发展，生物学数据库，生物信息学的主 要研究内容，以及生物信息学的简单介绍等内容，展望了其未来并提出了若干在 我国发展生物信息学的建议。着重指出，理解大量生物学数据所包括的生物学意 义已成为后基因组时代极其重要的课题。生物信息学的作用将日益重要。有理由 认为，今日生物学数据的巨大积累将导致重大生物学规律的发现。生物信息学的 发展在国内、外基本上都处在起步阶段。因此，这是我国生物学赶超世界先进水 平的一个百年一遇的极好机会 关键词：生物信息学，人类基因组计划，数据库，，基因组. 生物信息学的简介 生物信息学 （Bioinformatics）是在生命科学的研究中，以计算机为工具对生 物信息进行储存、检索和分析的科学。 具体而言，生物信息学作为一门新的学 科领域，它是把基因组DNA 序列信息分析作为源头，在获得蛋白质编码区的信 息后进行蛋白质空间结构模拟和预测，然后依据特定蛋白质的功能进行必要的药 物设计。基因组信息学，蛋白质空间结构模拟以及药物设计构成了生物信息学的 3 个重要组成部分。从生物信息学研究的具体内容上看，生物信息学应包括这 3 个主要部分：（1）新算法和统计学方法研究；（2 ）各类数据的分析和解释；（3 ） 研制有效利用和管理数据新工具。 生物信息学是在生物研究领域的许多方面起中心作用的一个广泛的领域， 在这些生物研究领域中最重要的就是基因组学，更明确地说就是基因测序、基 因图谱的绘制、 基因注释和多种基因的比较等； 同时， 生物信息学对于转录 组学也是比较重要的； 此外， 生物信息学在分析应用 生物芯片方法或者样本 基因序列的某些形式测量得到的基因表达数据方面起着重要作用； 生物信息学 在蛋白质组学中的应用也是十分广泛，它可以分析蛋白质序列 （比如说测定活 性中心） ， 进行蛋白质多样性研究 （所使用的典型测量方法是双向凝胶和质 谱分析） ， 通过计算和实验的方法来判断蛋白质的结构， 生物信息学在分析 蛋白质 蛋白质相互作用和作用的分子路径以及在基因修正的系统研究中也起了 关键作用；它在遗传学研究领域也有其重要的地位，它既可以用来发现新的分 子遗传标志 （比如单 核甘酸的多态性） ，也可以应用新发现的及现有的遗传标志来研究疾病和其它 显型的遗传基础。 生物信息学的产生和发展 生物信息学的产生发展仅有10 年左右的时间bioinformatics 这一名词在 1991 年左右才在文献中出现，还只是出现在电子出版物的文本中。事实上，生 物信息学的存在已有30 多年，只不过最初常被称为基因组信息学。 基因组信息是生物信息中最基本的表达形式，并且基因组信息量在生物信 息量中占有极大的比重，但是，生物信息并不仅限于基因组信息，生物信息学也 不等于是基因组信息学。生物信息不仅包括基因组信息，如基因的DNA 序列、 染色体定位，也包括基因产物（蛋白质或RNA ）的结构和功能及各生物种间的 进化关系等其他信息资源。生物信息学既涉及基因组信息的获取、处理、贮存、 传递、分析和解释，又涉及蛋白质组信息学如蛋白质的序列、结构、功能及定位 分类、蛋白质连锁图、蛋白质数据库的建立、相关分析软件的开发和应用等方面， 还涉及基因与蛋白质的关系如蛋白质编码基因的识别及算法研究、蛋白质结构、 功能预测等，另外，新药研制、生物进化也是生物信息学研究的热点。 生物信息学的主要研究内容 1. 序列比对 （Alignment ）。 基本问题是比较两个或两个以上符号序列的相似性或不相似性。序列比对是生物 信息学的基础，非常重要。两个序列的比对有较成熟的动态规划算法，以及在此 基础上编写的比对软件包--BALST 和FASTA，可以免费下载使用。这些软件在 数据库查询和搜索中有重要的应用。有时两个序列总体并不很相似，但某些局部 片断相似性很高。Smith-Waterman 算法是解决局部比对的好算法，缺点是速度 较慢。两个以上序列的多重序列比对目前还缺乏快速而又十分有效的算法。 2. 结构比对。 基本问题是比较两个或两