昆医分生蛋白质分子建模与设计演示文稿.pptVIP

**TrxA基因可编码109个氨基酸的硫氧还蛋白，外源基因经多克隆位点插入后，可与TrxA一起融合表达.融合表达不仅提高了表达产物的稳定性，而且由于相对分子质量增大，用SDS更容易分析鉴定.并可促进目标蛋白的溶解***************活性设计是第一步，主要是考虑被研究蛋白质的功能。涉及选择化学基团和化学基团的空间取向。一般选用天然存在的氨基酸来提供所需的化学基团。Scaffold设计指对蛋白质的立体设计。天然蛋白质都是框架化的，参与酶反应的几个重要集团就是他的框架。*例如通过引入二硫键期望提高蛋白质的稳定性，面临的一个问题是怎样选择合适的突变位点。蛋白质中的二硫键具有一定的结构特征，随机选择突变位点引入二硫键会给整个分子带来不利的张力，不但不会提高蛋白质的稳定性，反而会降低蛋白质的稳定性。*********癌胚抗原（CEA）最初发现于结肠癌和胎儿肠组织中，故名癌胚抗原。97％的健康成人血清CEA浓度在2．5ng／mI以下。CEA升高常见于大肠癌、胰腺癌、胃癌、小细胞肺癌、乳腺癌、甲状腺髓样癌等。CEA超过20ng／ml时往往提示有消化道肿瘤。

但吸烟、妊娠期和心血管疾病、糖尿病、非特异性结肠炎等疾病，15％～53％的病人血清CEA也会升高，

所以CEA不是恶性肿瘤的特异性标志，在诊断上只有辅助价值。这个特别注意。

癌胚抗原（CEA)大于10mg/ml时,才提示有恶性肿瘤的可能**DON小麦镰刀菌毒素****IPTG:异丙基-β-D-硫代半乳糖苷*********镰孢菌产生的真菌毒素：玉米赤霉烯酮(zearalenone,ZENDON小麦镰刀菌毒素PCR验证以重组质粒为模板，进行Anti-DON基因的PCR分析。本文档共85页；当前第61页；编辑于星期六\6点50分双特异性抗体的表达本文档共85页；当前第62页；编辑于星期六\6点50分我们知道,蛋白质的空间结构受其氨基酸序列控制,而功能又与结构密切相关。如果能够找到构造蛋白质结构的方法,我们就能得到具有任意结构和功能的全新蛋白质,这就是蛋白质全新设计问题。第三节全新蛋白质设计本文档共85页；当前第63页；编辑于星期六\6点50分蛋白质从头设计概念从头设计能够根据生物分子的活性位点特征产生一系列的结构片段，通过连接这些结构片段可以构成一个全新分子；或者在结合腔内对一个已知的结构骨架进行化合物的衍生化。从头设计方法可以生成全新的分子结构。本文档共85页；当前第64页；编辑于星期六\6点50分全新蛋白质设计包括

一、全新蛋白质设计方法二、蛋白质结构的从头设计本文档共85页；当前第65页；编辑于星期六\6点50分全新蛋白质设计过程设计目标序列生成结构预测合成构建模型检测本文档共85页；当前第66页；编辑于星期六\6点50分（一）全新蛋白质设计程序模拟分析设计实验一、全新蛋白质设计方法本文档共85页；当前第67页；编辑于星期六\6点50分（二）全新蛋白质设计目标的选择依据设计的目的可以分为：从头结构设计从头功能设计本文档共85页；当前第68页；编辑于星期六\6点50分从头结构设计

中心问题：稳定及独特的三维结构序列；基本障碍：线性聚合构象熵；解决方法：（1）使相互作用的强度与数目达到最大；（2）共价交叉连接。本文档共85页；当前第69页；编辑于星期六\6点50分从头设计方法包含的步骤1、活性位点分析：对结合位点的具体的化学信息进行扫描、分析和归类。这些信息的三维空间相互关系都必须充分考虑。2、配体分子构建：采用不同的片段选择和分子构建方法，产生相应的分子结构。3、评价：使用特定的评分系统将构建的分子与活性位点的匹配性进行排序，可以选择其中优良的结果作为合成实验的对象。也可以将之做新一轮计算的起点进行进一步的优化。本文档共85页；当前第70页；编辑于星期六\6点50分二、蛋白质结构的从头设计（一）蛋白质结构的从头设计原则1．二级结构的设计原则α螺旋β折叠片转角2．超二级结构和三级结构的设计原则本文档共85页；当前第71页；编辑于星期六\6点50分α螺旋(PHPPH)(Leu、Glu