二代测序技术在原发灶不明肿瘤诊疗中的研究进展2023 .pdf

二代测序技术在原发灶不明肿瘤诊疗中的研究进展2023

摘要

原发灶不明肿瘤(cancerofunknownprimary,CUP)是一类罕见且预

后不良的恶性肿瘤，分析和寻找原发灶、组织类型或分子免疫特征对改善

患者的预后具有重要意义。在精准医疗背景下，二代测序

(next-generationsequencing,NGS)可以利用肿瘤组织或夕卜周血标

本从基因层面对这类患者进行检测以指导诊断与治疗，延长患者生存期，

改善预后。本文针对NGS样本的择、NGS指导下的CUP患者的组织

溯源、分子特征、指导治疗等方面进行综述。

前言

原发灶不明肿瘤(cancerofunknownprimary,CUP)是一类相对罕见

的肿瘤，即在体内发现了恶性肿瘤细胞，但无法通过临床、影像、病理及

实验室指标等全面检查从解剖学上确定原发灶部位的转移性肿瘤。大多数

CUP患者由于原发灶不明确，通常只能接受含钳/紫杉类的经验性化疗，

预后较差，生存期较短，中位总生存期＜1年[1-3,所以积极寻找原发部

位、研究组织类型或分子免疫特征对改善患者的预后具有重要意义。第二

代测序(next-generationsequencing,NGS)也称高通量测序，是目

前最常用的基因检测手段之一，可以在较短时间内检测出肿瘤患者的基因

变异情况，辅助指导临床诊疗。欧洲肿瘤内科学会(ESMO)、国家综合

癌症网络(NCCN)及中国抗癌协会都发布了关于在CUP患者中使用NGS

的建议,NGS可以帮助50.9%的CUP患者找到原发灶[4,并可检测出具

有临床指导意义的基因改变[5,包括靶向治疗靶点和免疫治疗生物标记

物。本文针对NGS样本的择、NGS指导下的CUP患者的组织溯源、

分子特征、指导治疗等方面进行综述。

01、NGS样本的择

对于适合NGS检测分析样本的择，临床中首新鲜肿瘤组织标本，也

可择福尔马林固定石蜡包埋的肿瘤组织、肿瘤细胞学样本及血浆等。未

接受过靶向/免疫药物治疗的患者，NGS检测应首经病理评估的组织样

本，优先使用手术切除样本，也可择活检样本，再次检测可择液体活

检样本进行动态监测；接受过靶向/免疫药物治疗的患者，应尽可能使用治

疗后的样本，进而寻找治疗后新出现的耐药突变。基于手术切除或穿刺活

检的肿瘤组织是CUP分子检测的主要样本，当转移性肿瘤组织样本难以

获取或组织样本质控不合格时，体液样本，尤其是外周血循环肿瘤DNA

(circulatingtumorDNA,ctDNA)则是研究CUP起源和分子特征的

一种可行方法。与组织学检测相比，夕卜周血ctDNA检测具有无创或微创、

可反复取材等优势[6,但受正常细胞胚系变异或克隆性造血细胞体系突变

干扰，也会导致假阳性结果[7-8,假阳性率＜1%[9]。

02、NGS在CUP诊疗中的意义

2.1组织溯源，明确诊断

基因表达谱可在分子水平揭示肿瘤的组织起源，通过对比分析待测肿瘤组

织样本与已知来源肿瘤分子层面的相似性，可以鉴别其肿瘤类型，寻找原

发灶。日本研究团队的一项前瞻性、多中心、非随机的临床II期研究［10］

招募了111例CUP患者，基于NGS的RNA和DNA图谱分析预测出15

个肿瘤原发部位，其中最常见的是肺癌(21.6%)、肝癌(15.5%)、肾

癌(15.5%)、结眺癌(12.4%),这与既往尸检分析的结果类似［11］0

Schipper等［12］基于全基因组测序设计了一种预测算法，在CUP队列中，

最常见的原发肿瘤略有不同，分别为非小细胞肺癌、胃食管癌、胰腺癌和

结直肠癌。

M。等［13］报道了1例原发灶不明同时伴乳腺、肺、胃和卵巢多发性肿瘤

的患者，在乳腺和肺肿瘤组织中使用NGS检测到伴有棘皮动物微管结合

蛋白样与间变性淋巴瘤激酶融合基因(echinoderm

microtubule-associatedprotein-like4-anaplasticlymphoma

kinase,EML4-ALK)重排，该基因改变在非小细胞肺癌中较常见，综合

免疫组织化学及NGS结果考虑原发灶为肺。Yu等［14］报道了1例胸骨后

恶性占位性病变的患者，影像学均无法确定原发部位，通过NGS检测到

人表皮生长因子受体2(receptortyrosine-prot