基因组学与分子育种.pptVIP

限制酶作图（restrictionmapping）第31页，讲稿共49页，2023年5月2日，星期三荧光原位杂交

（fluorescentinsituhybridization，FISH）第32页，讲稿共49页，2023年5月2日，星期三荧光原位杂交

（fluorescentinsituhybridization，FISH）第33页，讲稿共49页，2023年5月2日，星期三荧光原位杂交

（fluorescentinsituhybridization，FISH）第34页，讲稿共49页，2023年5月2日，星期三荧光原位杂交

（fluorescentinsituhybridization，FISH）第35页，讲稿共49页，2023年5月2日，星期三遗传图与物理图的整合有些标记既是遗传标记，又是物理标记RFLP标记SSR标记某些基因序列借助这些标记可以将遗传图和物理图整合起来第36页，讲稿共49页，2023年5月2日，星期三第四节基因组测序有了高密度的基因组图谱，就可以开始全基因组测序了测序的技术飞速发展，现在可以全自动化测序的策略有两个：鸟枪法克隆重叠群法第37页，讲稿共49页，2023年5月2日，星期三鸟枪法（shotgunsequencing）第38页，讲稿共49页，2023年5月2日，星期三鸟枪法的优缺点优点：不需要高密度的图谱速度快、简单、成本低缺点：拼接组装困难，尤其在重复序列多的区域主要用于重复序列少、相对简单的原核生物基因组第39页，讲稿共49页，2023年5月2日，星期三克隆重叠群法（clonecontig）将基因组DNA切割长度为0.1Mb－1Mb的大片段，克隆到YAC或BAC载体上然后再进行亚克隆，分别测定单个亚克隆的序列再装配、连接成连续的DNA分子。这是一种自上而下（uptodown）的测序策略clone-by-clonemethod第40页，讲稿共49页，2023年5月2日，星期三两种基因组测序策略第41页，讲稿共49页，2023年5月2日，星期三TheE.coligenome第42页，讲稿共49页，2023年5月2日，星期三关于基因组学与分子育种第1页，讲稿共49页，2023年5月2日，星期三第一节基本概念1基因组genome：一个物种单倍体细胞所含有的整套染色体，物种全部遗传信息的总和，包括核基因组和细胞器基因组。植物基因组包括三部分：核基因组、线粒体基因组、叶绿体基因组第2页，讲稿共49页，2023年5月2日，星期三2基因组学genomics1986年提出，至今20年，已经发展成为遗传学中最重要的分支学科。定义：研究基因组结构、功能和进化的科学。第3页，讲稿共49页，2023年5月2日，星期三以全基因组测序为目标的结构基因组学（structuralgenomics）弄清基因组中全部基因的位置和结构，为基因功能的研究奠定基础。其目的是建立高分辨的遗传图谱、物理图谱、转录图谱和序列图谱。以基因功能鉴定为目标的功能基因组学（functionalgenomics)利用结构基因组学提供的信息，以高通量，大规模实验方法及统计与计算机分析为特征，全面系统地分析全部基因的功能。研究角度包括：生物学功能、细胞学功能、发育学功能等。基因组学研究内容基因组学研究应该包括两方面的内容：第4页，讲稿共49页，2023年5月2日，星期三A.遗传图谱B.物理图谱C.转录图谱D.序列图谱结构基因组学第5页，讲稿共49页，2023年5月2日，星期三A.遗传图谱：指基因或DNA标记在染色体上的相对位置与遗传距离。通常用cM表示（基因或DNA片段在染色体交换过程中分离的频率）。通过该图谱可分清各基因或DNA片段之间的相对距离与方向，如靠近着丝粒或端粒.水稻1号染色体第6页，讲稿共49页，2023年5月2日，星期三B.物理图谱：指DNA序列上两点间的实际距离。用于确定各遗传标志间的物理距离有两种物理图谱：（1）以已定位的DNA序列标记位点（STS）为位标，以DNA实际长度为图谱距离的基因组图谱。（2）由YAC和/或细菌人工染色体（BAC）连续克隆重叠群组成的物理图谱。第7页，讲稿共49页，2023年5月2日，星期三Acomprehensivericetranscriptmapcontaining6591expressedsequencetagsitesC.转录图谱：以EST为位标，根据转