基于免疫浸润性相关LncRNA的食管腺癌预后模型的构建及风险分析.pdfVIP

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基于免疫浸润性相关LncRNA的食管腺癌预后模型的构建

及风险分析

1，2，31，2,331，2,33

刘林壮吴柳盛侯清华王汉文刘继先

1.安徽医科大学北大深圳医院临床学院·北京大学深圳医院，广东深圳518036

2.安徽医科大学研究生学院，安徽合肥230032

3.北京大学深圳医院胸外科，广东深圳518036

摘要：目的本研究分析食管腺癌肿瘤细胞的免疫浸润情况，筛选LncRNA基因，构建食管腺癌预后模型，以评估

患者的生存预后，探索潜在的治疗靶点。方法在TCGA公共数据库中下载89例食管腺癌患者的资料，其中包括

11例正常组织标本和78例食管腺癌肿瘤组织标本资料。本研究采用Perl和R软件进行代码运行和统计处理，

计算患者的风险系数，随后进行Cox回归分析、免疫预后相关LncRNA生存分析、风险分析、PCA分析和ROC曲

线分析。结果我们筛选和鉴定了19个包含LINC01612、AC008443.2和LINC02582在内的预后生物标志物并构建

预后模型，根据此模型将病人分为高风险组和低风险组，Kaplan‐Meier生存分析两组存在显著差异(P0.001)。

同时，用ROC曲线评估食管腺癌预后模型的可行性，发现该模型具有较高的预测性(AUC=0.964)。在这项研究中，

对复杂的转录组测序数据和其他立方体进行PCA分析，以将数据转换到由特征向量构建的三维空间中。结论本

研究有效筛选和鉴定了与食管腺癌免疫侵袭相关的LncRNA，并成功构建了预后模型。LINC01612、AC008443.2和

LINC02582等19个潜在的诊断和治疗靶基因，对食管腺癌患者的临床治疗具有一定的指导意义。

关键词：食管腺癌；免疫浸润；预测模型；LncRNA

中图分类号：R737文献标识码：A

ModelconstructionandriskanalysisofLncRNAgenes

associatedwiththeprognosisofesophageal

adenocarcinoma(EAC)withimmuneinfiltration

LIULinzhuang1,2,3WULiusheng1,2,3HOUQinghua3WANGHanwen1,2,3LIUJixian3

1.PekingUniversityShenzhenHospital,ClinicalCollegeofAnhuiMedicalUniversity,GuangdongShenzhen

518036

2.Departmentofgraduateschool,AnhuiMedicalUniversity,AnhuiHefei230032

3.DepartmentofThoracicSurgery，PekingUniversityShenzhenHospital，GuangdongShenzhen518036

Abstract:ObjectiveOurstudyanalyzedtheimmuneinfiltrationofesophagealadenocarcinomatumorcellsandscreened

LncRNAgenestoconstructaprognosticmodelofesophagealadenocarcinoma,soastoevaluatethesurvivalprognosis

ofpatientsandexplorepotentialtherapeutictargets.Me