西番莲DNA条形码遗传多样性分析.docx

基金资助项目：广东省科技计划项目（2015A020209172）；广东省现代农业技术研发中心（特色水果）建设项目

西番莲DNA条形码遗传多样性分析

叶婵娟1马泽铭1周玲艳1刘文1,2柯辉鹏2梁红1*

(1.仲恺农业工程学院，生命科学学院，广州510225；2.广州云震生物科技有限公司，广州510160)

摘要：对来自四个国家（地区）的13份西番莲种质用的ITS、trnL-F、trnH-psbA三种DNA条形码进行遗传多样性分析。结果显示：trnH-psbA条形码扩增出来的DNA序列的GC含量最低（27%），ITS条形码的DNA序列的GC含量最高（63%）。而trnL-F条形码扩增出来的DNA序列的GC含量在不同种质间差异最大，在52.6%-62.3%之间。将3种DNA条形码序列在GeneBank中进行Blast比对，ITS和trnL-F序列基本上与GeneBank已登录种的序列一致，达到77%以上，而trnH-psbA条形码序列与GeneBank的已登录种不一致。ITS条形码在序列间基因进化多样性分析的结果显示在两两的序列之间都具有差异；在rnL-F条形码序列的两两比较分析结果中，T1，T10，T11，T12，T13这几个条形码序列之间都没有差异；trnH-psbA条形码序列的两两比较分析结果的差异最小，而H4与其它的序列差异较大，数值在13.3以上。从系统进化树来看，trnH-psbA条形码序列除了H4之外，其它的样品聚为一类，trnL-F条形码序列中有5个不存在遗传差异，ITS条形码序列聚类的结果显示，每一种西番莲均存在一定的遗传距离，这与基因多样化分析的结果一致。结论：通过西番莲种质三种DNA条形码的多样性差异分析，表明ITS在不同种质之间具有较高的多样性，可考虑应用于种质鉴定。

关键词：DNA条形码；西番莲；遗传多样性；聚类分析

中图分类号：文献标识码：A文章编号：

TheGeneticDiversityAnalysisofPassifloraDNAbBarcode

(YeEChanjuan1MaAZeming1ZhouHOULingyan1LiuIUWen1,2KeEHuipeng2LiangIANGHong1*)

(1.Collogeoflifesciences,ZhongkaiUniversityofAgricultureandEngineering，Guangzhou510225,China;

2.GuangzhouYunzhenBiologicaltechnologiesLimited,Guangzhou510160,China.)

Abstract:TheITSbarcode,trnL-Fbarcode,andtrnH-psbADNAbarcodewereusedtoanalyzethegeneticdiversityof13Passifloragermplasmsfromfourdifferentcountryorareas.Theresultsshownthat,trnH-psbAbarcodewaswiththelowestGCcontent(27%),ITSbarcodewiththehighest(63%),andtrnL-FbarcodewithhighlydifferentGCcontentamonggermplasms(52.6%-62.3%).TheblasttoolinGeneBankwasusedfor3barcodealignment,allofITSandtrnL-Fwereover77%similartotheaccessionsofthespecies,trnH-psbAbarcodesequenceswereunconformablewithaccessionsinGeneBank.TheITSdiversityanalysisofgeneevolutionwasfounddifferentamongallPassiflorasamples.ThereisnotevolutionarydivergenceamongT1,T10,T11andT12intheirtrnL-Fbarcodediversity.ThetrnH-psbAbarcodesshowedtheminimaldiversi