分子系统学与分子鉴定.pptVIP

合意树：在“Trees”菜单中，点击“ComputeConsensus…”，选中“Strict”，点击“OK”，获取严格的合意树。系统发育关系分析

第29页，课件共67页，创作于2023年2月第30页，课件共67页，创作于2023年2月系统发育关系分析赋根：在“Options”的下拉菜单中选中“Rooting”，为树赋根；有两种方案，①是Outgrouprooting；②是Midpointrooting第31页，课件共67页，创作于2023年2月系统发育关系分析输出树：在“Trees”下拉菜单中选择“Printtrees…”以打印树。参数设置如下：Plottype=RectangularCladogramLinewidth=1.5Font=HelveticaSize=14Styles=BoldItalic。第32页，课件共67页，创作于2023年2月评价结果的可靠性

在得到树（或树集）后，必需做的是评价结果的可靠性。主要有Bootstrapping方法。Bootstrapping（Felsenstein，1985）用于评价系统树各节点的支持率，通常支持率在90％以上是最可信的。在测试中共重复1000次。第33页，课件共67页，创作于2023年2月选中Bootstrap