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- 2024-04-07 发布于广东
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蛋白序列数据库种类繁多,各有特色。根据实际情况,通常结合几个不同数据库对结果进行比较以下介绍3种数据库1、PIR数据库(Proteininformationresource)网址:http://www.nbrf./pir/1984年美国国家生物医学研究基金会(NBRF)创建, 源于1960(Dayhoff)《蛋白质结构与结构图册)1988年成立国家蛋白质信息中心(PIR-Interantional)共同收集和维护PIR国际蛋白序列数据库(PIR-PSD)是一个全面的、经过注释的、非冗余的蛋白质序列数据库,提供一个蛋白序列数据库、相关数据库和辅助工具集成系统一、常用蛋白质序列数据库第32页,共56页,2024年2月25日,星期天PIR提供3种类型的检索服务基于文本的交互式查询,用户通过关键词进行数据查询标准序列搜索和比对:BLAST、FASTA等工具高级搜索:结合序列相似性、注释信息和蛋白质家族信息的高级搜索,包括按注释分类的相似性搜索、结构域搜索等PIR包括3个子数据库,蛋白质序列数据库(PIR-PSD)蛋白质分类数据库(iProClass)非冗余蛋白质参考资料数据库(PIR-NREF)第33页,共56页,2024年2月25日,星期天2.SWISS-PROT数据库http://www.eb
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