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植物microRNA预测方法研究及计算机实现的开题报告

研究背景与意义：

植物microRNA（miRNA）是一类小RNA分子，相比于其他siRNA和piRNA等RNAs，它们的长度通常在20-24nt之间。在植物中，miRNA可以通过与靶基因的mRNA结合，并诱导RNA降解或翻译抑制来发挥重要的生物学功能。因此，研究植物miRNA在调控植物生长和发育中的作用对于理解植物遗传调控机制和育种和生物技术应用具有重要意义。

现有的miRNA预测方法大致分为实验和计算两类。实验方法包括Northernblotting、mRNA对丰富RNA（mRNA-capture）等方法，但由于成本昂贵、时间耗费大等缺点，计算方法逐渐成为研究者的首选方法。计算方法主要分为两类：1）blasting-based方法，通过比对miRNA序列和已知miRNA数据库中的miRNA序列进行预测；2）机器学习方法，通过构建分类器来预测潜在的miRNA序列。然而，目前的miRNA预测方法仍面临着很多挑战，如准确性低、假阳性率高等问题。

因此，开展植物miRNA预测的研究与实现，对于建立高效、准确和可靠的miRNA预测方法，为深入研究植物miRNA调控机制以及推动植物遗传育种和生物技术应用具有重要意义。

研究内容：

本研究计划通过以下几个方面，研究和实现植物miRNA预测方法：

1.数据预处理：获取并收集包括植物mi