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基于工作流引擎的蛋白质空间结构预测和分析系统的开题报告
1.研究背景
蛋白质结构与功能密切相关，但蛋白质结构的实验测定是非常耗时和昂贵的。因此，发展预测蛋白质结构的计算方法对于科学研究和应用具有重要意义。目前已有大量的计算方法被开发出来，但这些方法有时需要长时间的计算和大量的存储空间，而且难以集成到可视化环境中使用。
2.研究内容
本研究将基于工作流引擎，开发一个蛋白质空间结构的预测和分析系统。主要开发以下功能：
(1)蛋白质的三维结构预测
基于蛋白质序列信息以及结构预测算法，实现蛋白质的三维结构预测。该功能需要较大的计算量和存储空间，因此将采用分布式计算和存储技术，提高计算和存储效率。
(2)蛋白质的结构分析
通过预测得到的蛋白质结构进行分析，包括基于蛋白质结构的物理和化学性质的分析等。
(3)蛋白质结构可视化
通过可视化技术，将蛋白质结构展示出来，方便用户进行进一步的分析和研究。
3.研究目的和意义
本系统的开发可以为生物学、生物信息学、药物研发等领域提供一个方便、高效的蛋白质结构预测和分析平台，有助于加快科学研究和技术创新的进程。
4.研究方法和技术路线
本研究将采用以下方法和技术：
(1)工作流引擎技术
利用工作流引擎技术，将系统功能分解为多个任务，并通过任务之间的依赖关系，实现自动化的任务调度和执行。
(2)蛋白质结构预测算法
结合已有的蛋白质结构预测算法，针对性地开发新的算法，并进行算法性能的综合评估和优化。
(3)可视化技术
利用可视化技术，将蛋白质结构以三维图像的方式呈现出来，以便用户进行更为直观的分析与研究。
5.预期结果
基于工作流引擎的蛋白质空间结构预测和分析系统，将能够实现蛋白质结构的快速、准确和高效预测，并实现可视化和分析功能。经过实验验证和性能评估，可为科学研究和技术创新提供一个高效的平台。
6.参考文献
(1)LiY.,YinC.,XueY.D3NE:Usingdifferentialevolutionaryalgorithmwiththree-dimensionalneighborhoodencodingschemetopredictprotein-proteininteractionsfromproteinsequences.PLoSOne,2012,7:e40768.
(2)YangJ.,ZhangY.I-TASSERserver:newdevelopmentforproteinstructureandfunctionpredictions.NucleicAcidsRes,2015,43:W174-181.
(3)GeerL.Y.,Marchler-BauerA.,GeerR.C.,HanL.,HeJ.,HeS.,LiuC.,ShiW.,BryantS.H.TheNCBIBioSystemsdatabase.NucleicAcidsRes,2010,38:D492-496.
(4)ChenH.,ZhouH.X.Predictionofsolventaccessibilityandsitesofdeleteriousmutationsfromproteinsequence.NucleicAcidsRes,2005,33:3193-3199.
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