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QIAGEN?PlasmidPurificationHandbook
?
使用前注意事项:
1.?在提low-copy(低拷贝)增加lysisbuffer(裂解液)体积可以提高碱性裂解的效率以及DNA的产量。
2.?BufferP1在使用前加RNaseAsolution(RNA酶溶液),一瓶BufferP1加入一小瓶RNaseA(用前瞬时离心),终浓度为100ug/ml。
3.?检测BufferP1是否有因低温储存而引起的SDS沉淀。如有必要,将SDS在37℃溶解。
4.?BufferP3在4℃下预冷。
5.?选择性操作:把提供的LyseBluereagent(LyseBlue试剂)加入到BufferP1并在用前混匀。一瓶BufferP1加一小瓶LyseBlue(用前瞬时离心),这样LyseBlue被稀释1000倍。
步骤(蓝色为大提的量,括号里为中提的量。)
1.??????在选择平板上挑选一个单克隆,在相应抗性的LB2—5ml中进行初培养:37℃摇床约300rpm下初培养约8h。??(使用的管子或烧瓶至少是培养体积的4倍。)
2.??????将初培养菌液用选择性LB培养基稀释到1/500到1/1000。High-copyplasmid(高拷贝质粒):用100-200ul(25-50ul)初培养液接种100ml(25ml)介质。Low-copyplasmid(低拷贝质粒):用250-500ul(100-200ul)初培养液接种500ml(100ml)。37℃摇床约300rpm下初培养约12-16h。???(使用的烧瓶或容器至少是培养体积的4倍。培养细胞的浓度要达到约3-4×109个/ml,也即是每毫升的细胞干重约3g左右)
3.??????4℃离心机6000×g离心15min收集细菌细胞。
??(如果想在此步骤停止以后再做,把细胞-20℃冻存。)
4.10ml(4ml)BufferP1重悬细菌细胞。
(为了使裂解液充分混合进而能有效溶解,需使用较大的容器。并确保BuferP1里已经加入RNaseA。如果BufferP1里已经加入LyseBluereagent,为确保LyseBlue颗粒完全重悬使用前摇一下Buffer瓶子。为使细菌完全重悬,可以斡旋或者用胶吸管来回上下打散细胞直到没有细胞团留下为止。)
6.?加入10ml(4ml)BufferP2,上下颠倒封盖的管子4-6次彻底混合溶液,室温(15-25℃)下放置5min。???
(不要斡旋,因为斡旋能导致基因组DNA被剪断。裂解液会有粘性。溶解反应不要超过5min。装有BufferP2的瓶子用后要立即盖紧,以免被空气中的CO2酸化。
如果BufferP1里加有LyseBlue,那么在加入BufferP2后细胞悬浮液会呈现蓝色。混匀后悬浮液的颜色会很均一。如果悬浮液仍有无颜色区或者褐色细胞团存在,请继续混合直到颜色均一为止。)
6.加10ml(4ml)预冷的BufferP3,立即上下颠倒4-6次混匀,然后放冰上20min(15min)。
(预冷的BufferP3和冰上放置能促进沉淀。加入BufferP3后有乳白色的物质形成且裂解液粘性度减少。沉淀物中含有基因组DNA、蛋白质、细胞残渣和KDS。为保证potassiumdodecylsulfate(十二烷基磷酸钾)沉淀,裂解液要充分混合。若混合液依旧粘稠,请继续混合彻底中和溶液。
如果使用了LyseBlue试剂悬浮液混匀后蓝色要彻底消失呈现无色。悬浮液均匀无色表明SDS已完全沉淀。)
7.?≧20,000g4℃离心30min。立即转移含有质粒DNA的上清液。
(离心前样品需再次混合。离心要在非玻璃管(如聚丙烯)内进行。离心后上清液应是清晰透明的。)
8.?把上清液≧20,000g4℃离心15min。立即转移含有质粒DNA的上清液。
(进行第二次离心是避免仍有悬浮或颗粒物质存在于QIAGEN-tip。是样品浑浊的悬浮物质能阻止QIAGEN-tip并且会降低或消除重力流。
→(样1)从清晰的裂解上清液里取120ul(240ul)样品保存以备跑分析胶确定生长和裂解状态是否最佳。)
9.?用10ml(4ml)BuferQBT平衡QIAGEN-tip500(QIAGEN-tip100)以使柱子为空重力流。
(因为平衡液中有洗涤剂存在,buffer流将通过降低表面张力自动开始。使得QIAGEN-tip彻底排空。因为当半月液面达到柱子的上个玻璃面时buffer流会停止,所以QIAGEN-tip可以无人看着。)
10.从第8步道到QIAGEN-tip用上清液使它通过重力流进入树脂。
(上清液应该立即转移到QIAGEN-tip上。如果
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