MBD2b蛋白亲和层析富集全基因组甲基化CpG岛方法的建立的开题报告.docxVIP

MBD2b蛋白亲和层析富集全基因组甲基化CpG岛方法的建立的开题报告

【摘要】

甲基化CpG岛在整个基因组中具有重要的生物学功能，其变化与许多疾病的发生和发展密切相关。目前，许多研究者利用甲基化芯片或测序的方法进行甲基化CpG岛分析，但该方法存在一定的局限性。因此，本研究将建立一种新的方法，通过MBD2b蛋白亲和层析技术来富集全基因组甲基化CpG岛，并结合高通量测序技术进行分析，实现对甲基化CpG岛的全面检测。

【关键词】

MBD2b；甲基化CpG岛；亲和层析；全基因组；高通量测序

【背景】

甲基化CpG岛是指DNA序列中连续的CpG二核苷酸组成的区域，在整个基因组中占比例较小，但是在基因的转录调控过程中具有重要的生物学功能。许多研究表明，甲基化CpG岛的异常变化与许多疾病的发生和发展密切相关，如肿瘤、心血管疾病等。因此，对甲基化CpG岛的研究具有非常重要的意义。

目前，许多研究者利用甲基化芯片或测序的方法进行甲基化CpG岛分析，但该方法存在一定的局限性。甲基化芯片虽然可以快速筛选甲基化CpG岛，但其检测范围较为有限，且容易出现假阳性和假阴性结果。测序技术可以全面地检测甲基化CpG岛，但其操作复杂度大，分析时间长，且数据分析难度较大。

因此，本研究将建立一种新的方法，通过MBD2b蛋白亲和层析技术来富集全基因组甲基化CpG岛，并结合高通量测序技术进行分析，实现对甲基化CpG岛的全面检测。

【目的】

1.建立一种新的方法，通过MBD2b蛋白亲和层析技术来富集全基因组甲基化CpG岛；

2.结合高通量测序技术对甲基化CpG岛进行分析；

3.探究甲基化CpG岛在基因调控中的生物学功能。

【方法】

1.提取DNA并进行质量检测；

2.制备MBD2b蛋白亲和层析柱；

3.对DNA进行消旋处理，将一部分DNA进行反甲基化处理；

4.进行MBD2b蛋白亲和层析富集甲基化DNA片段；

5.利用高通量测序技术对富集的甲基化CpG岛进行测序，并进行数据分析；

6.结合数据库对测序结果进行生物信息学分析。

【预期结果】

1.建立一种新的方法，通过MBD2b蛋白亲和层析技术来富集全基因组甲基化CpG岛；

2.通过高通量测序技术对甲基化CpG岛进行全面检测，并得到高质量的测序数据；

3.分析甲基化CpG岛在基因调控中的生物学功能。

【意义】

1.建立一种新的方法，丰富了甲基化CpG岛检测的手段；

2.对甲基化CpG岛的全面检测可以更加深入地探究其在基因调控中的作用；

3.对甲基化CpG岛与疾病的相关性进行更加深入的研究。