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第一章蛋白质

(Proteins)

;内容

蛋白质的基本组成单位氨基酸及其连接方式

蛋白质的一级、二级、三级、四级结构，模体、结构域

蛋白质一级结构与空间结构和功能的关系

蛋白质的理化性质及其提取、纯化的原理

蛋白质组和蛋白质组学;什么是蛋白质?;组成蛋白质的元素;蛋白质的分类;蛋白质的生物学重要性;1）作为生物催化剂（酶）

2）代谢调节作用

3）免疫保护作用

4）物质的转运和存储

5）运动与支持作用

6）参与细胞间信息传递;一、蛋白质的基本组成单位——氨基酸;H;非极性疏水性氨基酸

极性中性氨基酸

酸性氨基酸

碱性氨基酸;甘氨酸glycineGlyG5.97;色氨酸tryptophanTryW5.89;天冬氨酸asparticacidAspD2.97;几种特殊氨基酸;?半胱氨酸;（二）氨基酸的理化性质;pH=pI;2.紫外吸收;3.茚三酮反应;茚三酮反应(ninhydrinreaction);二、氨基酸在蛋白质分子中的连接方式

——肽键;+;*肽是由氨基酸通过肽键缩合而形成的化合物。;N末端：多肽链中有自由氨基的一端

C末端：多肽链中有自由羧基的一端;N末端;（二）几种生物活性肽;GSH过氧化物酶;体内许多激素属寡肽或多肽;蛋白质的分子结构包括：

一级结构(primarystructure)

二级结构(secondarystructure)

三级结构(tertiarystructure)

四级结构(quaternarystructure);定义

蛋白质的一级结构（primarystructure）是指蛋白质分子中多肽链的氨基酸排列顺序。;一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础。;人胰岛素的一级结构

胰岛素由A、B两条多肽链组成，A链含21个氨基酸残基，B链含30个氨基酸残基。A链内有一个链内二硫键，A与B之间有两个链间二硫键。由于两条链之间由共价键相连接，所以胰岛素没有四级结构。;测序前的准备

N端分析以确定蛋白质的多肽链数目

断裂二硫键

分离单一多肽链

测定多肽链的氨基酸组成

多肽链氨基末端与羧基末端分析

二硝基氟苯（1-fluoro-2,4-dinitrobenzene）法

丹酰氯(dansylchloride)法

多肽链的氨基酸序列测定和重叠组合

对多肽链??行限制性水解成小片段

Edman降解法进行小片段肽段的序列分析

对各片段序列进行比较叠加，拼出完整的多肽序列;相对荧光值;常用的多肽链水解方法及其作用点;二、蛋白质的二级结构;（一）肽单元;蛋白质二级结构的主要形式;（二）?-螺旋;?-螺旋的基本要点;（三）?-折叠;（四）?-转角和无规卷曲;?-螺旋;锌指模体结构

锌指模体存在于类固醇激素受体超家族和一些转录因子中，属DNA结合蛋白。锌指模体约由30个氨基酸残基组成。4个半胱氨酸残基或2个半胱氨酸残基和2个组氨酸残基与1个锌离子配价结合。其中前一对半胱氨酸残基与后一对半胱氨酸（或组氨酸）残基之间相隔12个氨基酸残基。锌指模体的?-螺旋部分是与DNA结合的部位。;三、蛋白质的三级结构;目录;肌红蛋白(Mb);?-螺旋;（三）蛋白质的四级结构;?1;三、胶原蛋白的分子结构;某些组织中胶原蛋白的含量;胶原分子结构示意图

胶原分子是由三条多肽链组成的三股右手螺旋。第一条多肽链均为左手螺旋，每3个氨基酸残基螺旋上升一周。多肽链中富含甘氨酸和脯氨酸（羟脯氨酸），形成甘-脯-Y或甘-X-羟脯重复序列。三股螺旋中，甘氨酸的R基团位于分子内部，并与邻近的肽链形成链间氢键。此外，胶原分子内部链间与胶原分子之间还有赖氨酸残基之间形成的共价键，以维系胶原蛋白的稳定性。;蛋白质结构与功能的关系

TheRelationofStructureandFunctionofProtein;（一）一级结构是空间构象的基础;天然状态，有催化活性;（二）一级结构与功能的关系;表中九种动物之间胰岛素分子一级结构中存在的氨基酸残基组成

的差异不影响胰岛素的生物活性。临床上曾经应用猪和牛