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大肠杆菌和植物基因组DNA提
生科基彭健鹏2012141242048
1.大肠杆菌DNA提方案设计
实验目的
学习并掌握细菌基因组的提方法
提取大肠杆菌DH5α中的DNA并进行质量检测
实验概述
提DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含十二烷基硫酸钠(SDS)和
蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质,再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质,得
到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从溶液中析出。
试验准备
实验材料:大肠杆菌DH5α菌液
实验试剂:LB液体培养基,E溶液,10%SDS,蛋白酶K,5mol/LNaCl,
CAB/NaCl溶液,酚/氯仿/异戊醇,异丙醇,70%乙醇
实验仪器与用具:微量移液器,低温离心机,水浴锅,eppendorf管,恒温
摇床
实验步骤
(1)将2mL培养至对数期的大肠杆菌DH5α菌液5000rpm冷冻离心10分钟
弃上清;
目的:分离大肠杆菌与其培养液。
(2)加190μLE悬浮沉淀,并加10μL10%SDS,1μL20mg/mL蛋白酶K,
混匀,37℃保温1h;
目的:裂解大肠杆菌。
(3)加30μL5mol/LNaCl,混匀;
目的:盐析。NaCl降低DNA在水中的溶解度且不破坏其结构,从而提粗的
DNA。在浓氯化钠(1-2M)溶液中,DNP的溶解度很大,RNP的溶解度很小;
在稀氯化钠(0.14M)溶液中,DNP的溶解度很小,RNP的溶解度很大;
0.14MNaCl-0.01MEDA溶解RNP,而使DNP沉淀。
(4)加30μLCAB/NaCl溶液,混匀,65℃保温20min;
目的:CAB(十六烷基三乙基溴化铵)是一种去污剂,可溶解细胞膜,它能与
核酸形成复合物,在高盐溶液中(0.7mol/LNaCl)是可溶的,当降低溶液盐浓
度到一定程度(0.3mol/LNaCl)时,从溶液中沉淀。通过离心就可将CAB-核
酸的复合物与蛋白,多糖类物质分开。最后通过乙醇或异丙醇沉淀DNA,而CAB
溶于乙醇或异丙醇而除去。
(5)加入300μL酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)抽提,5000rpm离心10min,
将上清液移至干净离心管;
目的:分离蛋白多糖和DNA,得到较纯的DNA,若此步得到DNA不纯,可重
复此步骤进行多次纯化。
(6)加300μL异丙醇,颠倒混合,室温下静止10min,沉淀DNA;5000rpm
离心10min,沉淀DNA,加入500μL70%乙醇,5000rpm离心10min,弃乙醇,吸
干;
目的:将DNA沉淀出,进一步用乙醇促进DNA析出水。
(7)少量用光谱仪测DNA质量,并少量跑电泳。
目的:对DNA纯度的检测。
注意事项
DNA浓度和纯度的测定方法
从提取的DNA样品中取出1μL,用E稀释到100μL,用紫外/可见分光光
度计,分别测定260nm和280nm的吸光值OD260和OD280,计算检测DNA的纯
度、浓度和产率。
(1)DNA纯度=OD260/OD280
DNA的纯制品的OD260/OD280值为1.8,而RNA的纯制品的OD260/OD280值
为2.0。若OD260/OD280值高于1.8,那么说样品中可能有RNA的污染;若样品
中蛋白或酚的污染较严重则OD260/OD280值低于1.8。
(2)DNA浓度(ng/μL)=OD260×50μg/mL×100倍(1OD260=50ng/μl)
(3)DNA产率(ng/·FW)=OD260×50μg/mL×100倍×50μL/0.5(体
积/材量)
2.植物基因组DNA提
实验目的:
a)了解真核生物基因组DNA提取的一般原理;
b)掌握植物基因组DNA提取的方法和步骤。
实验原理:
c)使用液氮对植物叶片进行研磨,在保证破碎细胞的同时,会大大降低酶
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