(2.24)--24《我上遗传学》系列之二十四：保护基因组学——物种保护的灯塔.pdf

语《我上遗传学》刊登学生的一篇我上遗传学学习经验，供老师和同学们参考。

简介

基因组数据能告诉我们的信息是多样的，对于濒危物种而言，基因组数据所能反映的最重要的信

息就是种群的遗传状况，这些信息也为保护工作提供了重要的借鉴。

据国际自然保护联盟统计，目前有超过31000个物种受到了灭绝的威胁。这提醒我们动物保护是

一项迫在眉睫的工作[1]。

说到动物保护，大家会自然而然地联想到建立保护区、限制野生动物贸易、人工保育等方法。而

遗传学，在动物保护中能起到什么样的作用呢？

上世纪七十年代，科学家们提出了基因数据、进化理论与生物保护之间的关联，保护遗传学这一

概念由此出现；随着人类基因组计划的完成，Ryder提出在保护生物学中应用基因组学研究方

法。保护基因组学作为一个新兴的学科，快速地发展了起来[2]。

保护基因组学是一门将遗传学理论与分子技术相结合，来研究濒危物种的学科，服务于生物多样

性和濒危物种的保护和管理，最终达到保护物种遗传多样性与进化潜力的目的。将遗传学分析与

保护生物学相结合，可以帮助确定濒危物种的系统分类地位、减少近亲繁殖、减缓遗传多样性的

丢失，还可以帮助我们获得濒危物种的许多重要信息，例如种群大小、遗传结构、基因渗透、种

群历史。研究者们对越来越多的物种进行了基因组数据分析，为传统的保护工作提供了宝贵的参

考信息，也为保护工作带来了新的思路[3]。

下面，以几项研究为例，向大家介绍保护基因组学的工作：

1

朱鹮（Nipponianippon）

朱鹮（图片来源：互动百科）

朱鹮是非常美丽的一种鸟类，但是在1978年起、历时三年的调查中，仅发现了7只野生朱鹮。保

护工作者采取以野外自然繁育为主、圈养繁育为辅的策略，帮助朱鹮恢复种群[4]，截止目前，

全世界已有约2600只朱鹮，是国际濒危物种保护的成功范例。然而，经历了如此严重瓶颈效应的

朱鹮种群，遗传状况到底是否乐观呢？

在2019年发表的一项针对朱鹮的种群历史动态的研究中，研究人员使用现生种群的样本以及博物

馆标本进行分析，结果显示，一百多年来，朱鹮的遗传多样性丢失了近一半、近交系数上升3

倍、有效种群大小下跌、纯合有害突变的数目上升[5]。

图为朱鹮历史种群与现生种群的核苷酸多样性（π）的比较，可见，历史种群的核苷酸多样性明显低于现生种群[5]

图为朱鹮的有效种群大小、近交系数与其他物种的比较，可见，朱鹮的近交系数非常高，并且与有效种群大小相似的

物种相比，近交系数还要更高[5]

朱鹮的遗传状况仍然不容乐观，在保护工作中，我们需要考虑到如何能够尽可能避免多样性的丢

失、减少近亲繁殖。

2

大熊猫（Ailuropodamelanoleuca）

大熊猫（图片来源：Google）

大熊猫是我们非常熟悉的国宝。经保护工作者不懈的努力，野生大熊猫种群数量和栖息地面积均

处于逐渐增长态势，保护工作成效显著。2016年，IUCN将大熊猫受威胁等级从濒危下调至易

危。

2013年一项对大熊猫基因组的研究告诉我们更多关于大熊猫种群状况和历史动态的信息。

图a展示了大熊猫起源以来的有效种群数目波动，黑线显示黄土的质量累计速率（MAR），以此表示空气中尘埃的

量，可见，大熊猫有效种群大小与空气尘埃量呈负相关；图b显示了大熊猫三个种群（QIN：秦岭、MIN：岷山、