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遗传学是研究生物遗传与变异规律的科学,是生命科学中最富有综合性的学科,也是最具时
代气息的一门学科,正是由于这些特点,它赋予了遗传学教师充分的主观能动性和展示自我
风采的机会。为了展现全国高校遗传学一线教师的教学风采,加强教师间的教学经验交流,
让学生领略到不同知识点间的学习技巧,本公众号特邀全国一线遗传学教授,为大家奉上精
彩的教学经验系列《我上遗传学》。
谈笑有鸿儒,往来无白丁。众人拾柴火焰高,相信同仁们的智慧能让我们的遗传学教学呈现
异样的精彩!敬请关注。
染色体畸变(chromosomeaberration)中的结构变异(structuralvariation,SV)是经典遗
传学教材的重要内容之一,指的是染色体结构的大片段改变,包括重复
(duplication)、缺失(deletion)、倒位(inversion)和易位(translocation)等(图1)。
在过去的课堂上,我重点讲解“什么是结构变异”以及“不同结构变异的区别与联系”。近
年来,随着医学遗传学和基因组学的不断发展,我尝试和学生们深入讨论“基因变异与
结构变异的区别”、“结构变异从哪里来?”以及“结构变异的遗传学效应”等问题。我希望
在思考这些问题的过程中,学生们能够更加深刻地领悟研究染色体结构变异的重大意
义。
图1.几种常见的染色体结构变异类型。
01
遗传变异的定义与分类在很大程度上取决于技术的发展
我在教学中发现,不少学生将“基因变异”与“染色体畸变”错误理解为基因组
遗传变异中非此即彼的两种类型。但事实上,遗传变异的分类与遗传变异的
检测技术密切相关。传统的遗传变异检测方法包括Sanger测序和核型分析
(图2)。Sanger测序能够发现微小的变异(通常小于1kb)。这些突变通
常位于单个基因内部,所以称之为基因变异。但也可能出现因为变异所在的
基因组位置特殊,涉及多个基因或位于基因间隔序列的情况。核型分析是借
助染色体显色技术和光学显微镜发现的染色体变异。由于显色技术和显微镜
分辨率等技术瓶颈,这种方法适用于检测较大尺度的变异(通常大于
3Mb)。那么问题来了,介于1kb和3Mb之间的遗传变异是否存在呢?
答案当然是肯定的。
图2.Sanger测序和核型分析的
代表性结果
随着现代生物学技术的发展(图3),一大批新技术如比较基因组杂交
(comparativegenomichybridization,CGH)与SNP芯片等能够有效检测
介于1kb~3Mb之间的多种遗传变异,我们称之为亚显微水平
(submicroscopic)的结构变异。也就是说,遗传变异可以发生在从单个核
苷酸到全基因组的不同尺度上,但需要不同技术方法进行筛选。
图3:人类基因组结构变异的多种检测方法,引自Feuk等人(NatureReviewGenetics,
2006)
02
染色体结构变异的产生机制包括非等位同源重组和非同源
末端连接等。
棒眼果蝇是染色体重复的经典案例,纯合棒眼果蝇自交可以得到一定比例的重棒眼果
蝇,这是由于非等位的棒眼基因之间发生了不等交换,得到了一条有三拷贝重复的染色
体,表型也更严重。不等交换,现在被定义为非等位同源重组(nonallelichomologous
recombination,NAHR),它
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