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4、表面效应(surfaceeffect)
疏水性“口袋”效应活性中心的疏水环境可排除水分子对酶和底物功能基团的干扰性吸引或排斥,防止底物与酶之间形成水化膜,有利于酶与底物的密切接触。
疏水口袋肽链底物4、表面效应(surfaceeffect)酶活性中心的必需基团按极性来分有亲核性基团:丝氨酸的羟基,半胱氨酸的巯基和组氨酸的咪唑基。酶活性中心的必需基团按极性来分有酸碱性基团:门冬氨酸和谷氨酸的羧基,赖氨酸的氨基,酪氨酸的酚羟基,组氨酸的咪唑基和半胱氨酸的巯基等。一些酶活性中心的氨基酸残基酶残基总数活性中心残基牛胰核糖核酸酶124His12,His119,Lys41溶菌酶129Asp52,Glu35牛胰凝乳蛋白酶245His57,Asp102,Ser195牛胰蛋白酶238His46,Asp90,Ser183木瓜蛋白酶212Cys25,His159弹性蛋白酶240His45,Asp93,Ser188枯草杆菌蛋白酶275His46,Ser221碳酸酐酶258His93-Zn-His95,His117判断和确定酶活性中心的主要方法酶的专一性研究:研究酶的专一性底物的结构特点、酶的竞争性抑制剂结构特点等。酶分子侧链基团的化学修饰法:例如1.用共价修饰的试剂作用于酶,查明保持酶活力的必需基团;2.亲和标记(合成底物类似物);3.—SH保护剂的使用;X-射线晶体衍射法:定点诱变法:用共价修饰的试剂作用于酶,查明保持酶活力的必需基团DFP的作用二异丙基氟磷酸酶的结构与功能的关系酶的一级结构是决定其催化功能最重要的化学结构,是酶发挥催化功能的结构基础。有相同催化功能的同一类酶,其活性中心的一些氨基酸序列有极大的同源性。如胰蛋白酶、糜蛋白酶、弹性蛋白酶均属于胰蛋白酶家族,这三种酶活性中心的氨基酸残基有25%的同源性,甚至二硫键的位置亦相同。酶的结构与功能的关系酶一级结构的差别也决定了催化性质的不同,如胰蛋白酶、胰糜蛋白酶和弹性蛋白酶三种蛋白酶的活性中心Ser残基附近都有一个在立体结构上的“口袋”状结构。由于三种蛋白酶的“口袋”状结构不同,决定其与不同底物结合即有不同特异性。酶的特异的三维空间结构是酶催化功能的基础酶的二、三级结构是维持酶的活性中心空间构象的必需结构第二节酶促反应机制MechanismofEnzymaticReaction一、酶作用专一性的机制酶分子活性中心部位,一般都含有多个具有催化活性的手性中心,这些手性中心对底物分子构型取向起着诱导和定向的作用,使反应可以按单一方向进行。酶能够区分对称分子中等价的潜手性基团(a)“三点结合”的催化理论认为酶与底物的结合处至少有三个点,而且只有一种情况是完全结合的形式。只有这种情况下,不对称催化作用才能实现。组HOCH3COOH组HOOCCH3OHL(-)乳酸D(+)乳酸(与LDH契合)(不能在LDH中的三点结合)精精L-乳酸脱氢酶的催化作用特异性(b)锁钥学说认为整个酶分子的天然构象是具有刚性结构的,酶表面具有特定的形状。酶与底物的结合如同一把钥匙对一把锁一样刚性模式:EmilFisher提出(c)诱导契合学说柔性学
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