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PDB数据库中查找蛋白质结构数据
1.
输入内容:比如
输入内容:比如2DC3
二.在线观看三维数据结构
4.选择3Dview,可视化蛋白三维结构视图呈现。由于是远程计算机服务器进行图型构建,且数据量较大,需要较长的时间才能在窗口显示。
5.蛋白结构显示的参数设定:
自定义设定
自定义设定
脚本选项:
下载三维数据文件
1.在查询结果窗口的右边找到以下图型。
如图:选择DownloadFiles。
2.确定下载的文件类型,一般根据你要使用蛋白质结构数据而定。
选择PDB).
3.用写字板打开PDB文件,可以看到蛋白质数据库文件实质也是文本文件。
4.下载Pymol,并安装。点DOWNLOAD进入下载,选择windows版本,并安装(需要paymoney)。
或到此网站下载:
选择win32,1.7.1.1版本。并安装,需要python编程软件的支持,可从360软件管件直接安装。安装如图:
使用详情参见教程,注意打开程序需要找到python的安装目录:C:\Python27\PyMOL,找到PyMOL.exe文件,双击启动程序。
打开2DC3.pdb
或使用RasMol软件进行三维视图分析,步骤同上。
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