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蛋白质分子设计;蛋白质分子设计;蛋白质分子的特殊性;蛋白质工程与蛋白质设计;第一节基于天然蛋白质结构的分子设计;计算机模拟;蛋白质分子设计大致涉及的几个重要方面;蛋白质分子设计大致涉及的几个重要方面;蛋白质三维结构知识的必要性;设计目标及解决办法;设计目标;二、蛋白质设计原理;④疏水及亲水基团需要合理地分布在溶剂可及表面及不可及表面。
⑤在金属蛋白中,配位残基的替换要满足金属配位几何。
⑥对于金属蛋白,围绕金属中心的第二壳层中的相互作用是重要的。
⑦最优的氨基酸侧链几何排列。
⑧结构及功能的专一性。形成独特的结构,独特的分子间相互作用是生物相互作用及反应的标志。实践表明这是蛋白质设计最困难的问题。;三、蛋白质设计中的结构-功能关系研究;定位突变种类;突变蛋白质结构的评估;蛋白质中功能残基的鉴定;结构与功能的容忍度;第二节全新蛋白质设计;蛋白质的全新设计内容;一、蛋白质结构的从头设计;二、蛋白质功能的全新设计;蛋白质的功能设计;第三节计算蛋白质设计
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