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基于SRAP分子标记的51份西瓜抗、感病毒病种质资源遗传多样性分析
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高宁宁李晓慧康利允常高正梁慎徐小利李海伦王慧颖赵卫星
摘要:【目的】利用SRAP分子标记对51份西瓜抗、感病毒病种质资源遗传多样性分析,为加速西瓜抗病毒病新品种的选育进程提供理论参考。【方法】利用筛选出的多态性引物对51份抗、感病毒病西瓜种质进行多态性扩增,利用NTsys-pc2.1e中的非加权组平均法(UPGMA)计算获得遗传相似系数,利用PopGeneVersion3.2计算不同类型西瓜的遗传多样性参数。【结果】从500对SRAP引物组合中筛选出18对扩增条带清晰稳定且多态性较高的引物,共扩增出402条清晰可辨的条带,其中多态性条带271条;平均每对引物可扩增出稳定清晰的条带22.33条,其中多态性条带15.06条,平均多态性比率達67.41%。观测等位基因数(Na)为1.6766、有效等位基因数(Ne)为1.3033、Neis基因多样性指数(H)为0.1878、Shannons信息指数(I)为0.2931,除感病毒型西瓜种质的Na高于抗病毒型西瓜种质外,感病毒型西瓜种质的其他遗传多样性指数均低于抗病毒型西瓜种质,表明抗病毒型西瓜种质的遗传多样性较感病毒型西瓜种质丰富。抗病毒型与感病毒型西瓜种质的遗传一致度为0.8924,遗传距离为0.1138。供试西瓜种质的遗传相似系数为0.62~0.95。在遗传相似系数0.78处,可将51份供试西瓜种质划分为四大类群,抗病毒型西瓜种质分布在Ⅰ和Ⅱ类群中,感病型种质均集中在第Ⅲ、Ⅳ类群中,野生西瓜种质与其他西瓜种质的亲缘关系最远。遗传相似系数矩阵和UPGMA聚类矩阵之间的相关性明显(r=0.914),可准确地体现供试西瓜种质之间的遗传关系。【结论】筛选出的SRAP引物组合具有较好的品种鉴别能力,可用于西瓜种质的遗传多样性分析。抗病毒型与感病毒型西瓜种质的亲缘关系较近,遗传多样性丰富度不高,应加大发掘优良抗病种质资源力度,以拓宽西瓜的遗传基础。
关键词:西瓜;SRAP;遗传多样性;抗病毒;分子标记
:S651.034??????????????文献标志码:A:2095-1191(2021)05-1174-09
Abstract:【Objective】Toprovidetheoreticalreferenceforacceleratingthebreedingprocessofantivirusvarietiesofwatermelon,thegeneticdiversityof51germplasmresourcesofantiviruswatermelonwereanalyzedbySRAPmolecularmarkers.【Method】Thepolymorphicprimerswereselectedtoamplify51antivirusandsusceptiblegermplasmresourcesofwatermelon.Thegeneticsimilaritycoefficientswerecalculatedbyunweightedpairgroupmethodwitharithmeticavera-ge(UPGMA)byNTsys-pc2.1e.GeneticdiversityparametersofdifferenttypesofwatermelonwerecalculatedbyPopGeneVersion3.2.【Result】Eighteenpairsofprimerswithclearandstablebandsandhighamplifiedpolymorphismwereselectedfrom500pairsofSRAPprimers,andatotalof402clearlyidentifiablebandswereamplified,amongwhich271werepolymorphicbands.And22.33stableandclearbandswereamplifiedonaveragewitheachpairofprimers,including15.06polymorphicbands,withanaveragepolymorphismrateof67.41%.Theobservednumberofalleles(Na)was
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