宏基因组二代测序报告、标本类型、送检保存要求、标本运输、内容解释及微生物致病概率分级.pdf

宏基因组二代测序报告、标本类型、送检保存要求、标本运输、内容解释及微生物致病概率分级--第1页

送检mNGS宏基因组二代测序报告情况、标

本类型、送检保存要求、标本运输要求、测

序情况、内容解释、微生物致病概率分级及

解读

宏基因组二代测序(mNGS)是基于核酸检测的微生物鉴定技术

其非预设性、高通量等优点而得到广泛应用。下呼吸道感染主要包括

社区获得性肺炎、医院获得性肺炎、免疫抑制宿主肺炎、慢性阻塞性

肺疾病急性加重、支气管扩张症合并感染等类型，临床表现多样，感

染微生物种类复杂，感染和定植鉴别困难，加之mNGS技术本身存

在的局限性，mNGS诊断效力的发挥有赖于选择恰当患者、采用适宜

标本以及进行合理解读。

需送检mNGS情况

(1)免疫抑制宿主疑似发生LRTI且临床表现提示非CAP常见

病原微生物所致者；

(2)LRTI患者发病初期即出现需要使用血管活性药物的感染性休

克、需要有创机械通气的呼吸衰竭、多脏器功能不全等危及生命的状

况时；LRTI经规范经验性抗感染治疗48—72h后，感染症状仍持续

加重或影像学快速进展者；

(3)聚集性发病疑似具有传染性、但无法明确病原体的LRTI；有

特殊病史且经验性治疗无效，病情较为严重的LRTI；临床考虑特殊

病原体(感染且病势迅疾或迁延者，常规培养困难或所在医疗机构无

法提供可靠的传统检测方案时；

(4)患者有LRTI症状或影像表现，经规范抗感染治疗后病灶吸

收延迟、病程迁延，需鉴别是否由非感染性疾病所致，可以在常规

宏基因组二代测序报告、标本类型、送检保存要求、标本运输、内容解释及微生物致病概率分级--第1页

宏基因组二代测序报告、标本类型、送检保存要求、标本运输、内容解释及微生物致病概率分级--第2页

病原微生物检测、感染生物标志物、病理等相关检查同时送检mNGS

以帮助鉴别诊断。

不建议送检mNGS情况

(1)免疫功能健全宿主罹患LRTI（包括重症肺炎)，经过规范的经

验性抗感染治疗病情已好转；

(2)LRTI已通过其他方法获得病原学结果，与临床特点相符，或

针对性治疗有效；

(3)无法获取优质标本。

mNGS标本类型

在LRTI的病原微生物诊断中，可用于mNGS检测的标本包括

痰(含诱导痰)、气管吸引物、支气管肺泡灌洗液（BALF）、经支气管

肺活检（TBLB）标本、经支气管内超声（EBUS）活检标本、经皮肺穿

刺活检标本、血液等。

mNGS送检及保存要求

(1)下呼吸道标本：包括痰(含诱导痰)、BALF、肺炎旁胸腔积液

等，原则上应在采集后立即送检。若标本不能立即送检，标本采集时

间与检测时间间隔≤24h，可在2—8℃保存。若标本采集时间与

检测时间间隔24h，DNA测序标本保存时间≤2周时可储存在

-20℃冰箱，保存时间超过2周则需储存在-80℃冰箱；需要进

行RNA测序的标本如果保存时间24h，均应保存在-80℃冰箱。

对于短期不做检测的液体样本，冻存前应分装保存在冻存管(≥500

μL/管)中。

(2)血标本：采集后4℃保存不超过8h，如果需要长期保存，

分离血浆后4