基于转录组日本沼虾免疫相关SNP挖掘与分析.doc

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2024-10-06 发布于湖南
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基于转录组日本沼虾免疫相关SNP挖掘与分析.doc

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基于转录组日本沼虾免疫相关SNP挖掘与分析

摘要：本项目通过对螺原体感染与未感染的日本沼虾血细胞转录组的深度测序分析，筛选出全部的SNP位点，对SNP所在的基因序列进行功能注释，并筛选出的重要免疫通路中的免疫相关SNP，同时通过对比分析日本沼虾感染与未感染螺原体的表达差异，筛选出差异表达基因，以此对差异表达的免疫相关SNP进行筛选与挖掘。结果显示不同样品中含有SNP的unigenes数目在4,500-6,000之间，SNP总数在19,000到26,000左右，其中转换远高于颠换，比例基本在1.7：1左右，SNP位置的平均深度在1-7,000左右。在各

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