聚丙烯酰胺凝胶电泳.ppt

**常用的标准凝胶是指浓度为7.5%的凝胶，大多数生物体内的蛋白质在此凝胶中电泳，能获得满意的结果。**为了在使用凝胶做实验时有较高的重现性，制备凝胶所用的Acr浓度，Bis和Acr的比例、催化剂的浓度、聚合反应的溶液pH值、聚胶所需时间等能影响泳动率的因子都必须保持恒定。**快离子很快移动到最前面，原来它停留在那部分地区则形成了低离子浓度区，即低电导区。低电导区有较高的电位梯度，就引起了电位梯度的突变。这种高电位梯度又使蛋白质阴离子和甘氨酸阴离子在此区域加速前进，追赶快离子。当快离子和慢离子的移动速度相等的稳定状态建立以后，快离子和慢离子之间造成一个不断向正极移动的界面。夹在快、慢离子间的样品蛋白质阴离子的移动界面就在这个追赶中逐渐被压缩，聚集成一条狭窄的区带。浓缩效应可使蛋白质浓缩数百倍。**凝胶的pH值明显增加,并导致甘氨酸的大量解离,有效泳动率增加.甘氨酸的分子量远小于蛋白质,它将赶上并超过各种蛋白质分子直接在氯离子后移动.这时,由于凝胶孔径变小,使蛋白质分子的迁移率减小,于是蛋白质分子在均一的电压梯度和pH环境中泳动,分子迁移速度与分子量大小和形状与其迁移率密切相关,分子量小且为球形的蛋白质分子所受阻力小,移动快,走在前面.**Figure1.TheSangersequencingreaction.SinglestrandedDNAisamplifiedinthepresenceoffluorescentlylabelledddNTPsthatservetoterminatethereactionandlabelallthefragmentsofDNAproduced.ThefragmentsofDNAarethenseparatedviapolyacrylamidegelelectrophoresisandthesequencereadusingalaserbeamandcomputer.关于聚丙烯酰胺凝胶电泳一、PAG的组成

PAG是由丙烯酰胺（acrylamide，Acr）单体和N，N’-亚甲双丙烯酰胺（N，N，N’，N’-methylenebixacrylamide，Bis）交联剂通过自由基聚合而成的一种多孔三维网状结构。Acr+Bis?多孔三维网状结构第2页,共30页，星期六，2024年，5月（1）丙烯酰胺结构式第3页,共30页，星期六，2024年，5月（2）亚甲双丙烯酰胺第4页,共30页，星期六，2024年，5月第5页,共30页，星期六，2024年，5月二、PAG的聚合

需要催化剂——氧化还原系统作用，使Acr单体带有游离基，从而与Bis进行聚合。第6页,共30页，星期六，2024年，5月（一）化学聚合：AP-TEMED系统过硫酸胺[(NH4)2S2O8]（Ammoniumpersulfate，AP）作为催化剂，四甲基乙二胺（TEMED）为加速剂。第7页,共30页，星期六，2024年，5月AP在水溶液中能产生游离基SO42-，使丙烯酰胺单体的双键打开，活化形成自由基丙烯酰胺，然后游离Acr和Bis作用就能聚合形成凝胶。TEMED的游离碱基能促进AP的形成SO42-。注意：?TEMED量多少都会影响催化作用，须在碱性条件下聚合?分子氧存在，聚合不完全，须去除分子氧，隔绝氧?升高温度能提高聚合，降低温度能延迟聚合第8页,共30页，星期六，2024年，5月（二）光聚合：核黄素-TEMED系统

核黄素（riboflavin）在光照下（可见光或紫外光）分解，其黄素部分被还原成无色型，但在有氧条件下无色型又被氧化成带有游离基的黄素，其也能使Acr和Bis聚合形成凝胶。注意：分离胶的合成一般采用化学聚合。因为若用光聚合，凝胶的孔径受光照强度与时间的影响，导致孔径大小不同，从而影响蛋白质的分离。第9页,共30页，星期六，2024年，5月三、PAG的浓度与孔径的关系

PAG孔径的大小主要由Acr和Bis这两种单体的浓度决定。可以根据要分离物质分子的大小，选择合适的单体浓度。Acr/Bis：20~40完全透明且有弹性；＜10很脆，易碎，不透明；＞100糊状不成形，易破碎。第10页,共30页，星期六，2024年，5月凝胶总浓度T——100ml凝胶溶液中含有Acr和