On Clone Assembly Problems An Error-Tolerant Test for Interval 克隆装配问题的区间容错性测试.pptVIP

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2024-10-24 发布于湖北
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On Clone Assembly Problems An Error-Tolerant Test for Interval 克隆装配问题的区间容错性测试.ppt

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1/28IntervalGraphTest

2/28ChordalGraphsAchordofacycleCisanedgenotinCwhoseendpointslieinCAnchordlesscycleinGisacycleoflengthatleast4inGthathasnochordAgraphGischordalifitissimpleandhasnochordlesscycle(alsocalledtriangulatedgraph)AninducedsubgraphonV’isasubgraphwithnodesetV’andallpossibleedgesbetweennodesinV’.

3/28PerfectEliminationOrderingAvertexofGissimplicialifitsneighborhoodinGisacliqueAperfecteliminationordering(PEO)isanorderingv1,…,vn–1,vnfordeletionofverticessothateachviisasimplicialvertexoftheremaininggraphinducedby{vi,…,vn-1,vn}

4/28PerfectEliminationOrderingv1,v2,v3,v4,v5,v6isaperfecteliminationorderingv1v2v4v3v5v6

5/28CharacterizationofChordalGraphsAgraphischordal?ithasaperfecteliminationorderingWeprovethistheoremthroughanalgorithmthatconstructaPEO (muchliketheplanaritytest)

6/28LexicographicBFS(LBFS)LBFSisusedtoobtainaperfecteliminationorderingforchordalgraphsvnvn-1vn

7/28LBFSandPEOTheorem1.IfGisachordalgraph,thenLBFSwillproduceaPEO.LettheorderingproducedbyLBFSbeOTheneighborsofuorderedafteruformaclique(i.e.uissimplicialintheremaininggraph)Howdoyouprovethis?

8/28Lemma1IntheLBFS,ifthereareverticesu,x,ys.t. L(u)L(x)L(y)and(u,y)?Gbut(x,y)?G,thentheremustexistavertexzwith L(y)L(z)s.t.(x,z)?Gbut(u,z)?GSupposenot.Theneveryneighborofxafteryisalsoaneighborofu.Butthen,ushouldberankedhigherthanxafterweprocessyintheLBFSordering.yuxyuxz

9/28ProofofTheorem1(I)Provebycontradiction.Supposethereexistverticesu,x,ys.t.L(u)L(x)L(y)and (u,x),(u,y)?Gbut(x,y)?G.WLOG,let(x,y)beamaximalsuchpair(i.e.foranyothersuchpair(x’,y’)eitherx’xory’y), then,byLemma1,thereexistsanx1with L(y)L(x1)s.t.(x,x1)?Gbut(u,x1)?G.x1yux