群体遗传学基础 (2).ppt

**二、分子进化（２）核苷酸DNA序列变化包括替换、缺失、插入和倒位等；以替换为主。同义替换：不影响密码子编码的氨基酸非同义替换：影响密码子编码的氨基酸DNA进化速率：每年每个核苷酸被替代的比例。第63页,共67页，星期六，2024年，5月**二、分子进化（２）核苷酸单位进化时间（UnitEvolutionaryPeriod，UEP）：在一个被研究的谱系（lineage）的两个分支点，起初完全相同的核苷酸相差１％所需的时间（百万年）。如珠蛋白基因家族的UEP为10.4。第64页,共67页，星期六，2024年，5月**二、分子进化（２）核苷酸影响DNA进化速率的因素不同基因，假基因突变种类基因的不同区域：编码区、内含子、5’侧翼序列、5’非翻译区、3’非翻译区第65页,共67页，星期六，2024年，5月**二、分子进化（３）mtＤＮＡ替换速率高基因的空间排列和基因组的大小在各物种间相当稳定，说明核苷酸替代速率和结构进化速率间的无关性，即这两个过程是独立的母体遗传，存在于细胞质中第66页,共67页，星期六，2024年，5月*感谢大家观看第67页,共67页，星期六，2024年，5月**（二）隐性个体的不完全选择q的一代变化率第31页,共67页，星期六，2024年，5月**(二）隐性个体的不完全选择当s=0.01或者更小时，分母接近１，有第32页,共67页，星期六，2024年，5月**（三）测交选择显性纯合子公畜精子卵子A(1)A(p0)AA(p0)a(q0)Aa(q0)每世代都对公畜进行测交，对母畜不作选择第33页,共67页，星期六，2024年，5月**（三）测交选择显性纯合子公畜下一代的基因型频率：D1=P0,H1=q0,R1=0下一代的基因频率：q1=H1/2=q0/2,q2=h2/2=q0/22qn=q0/2n??nlg2=lg(q0/qn)n=(lgq0-lgq0)/lg2第34页,共67页，星期六，2024年，5月**（四）淘汰部分显性，随机交配基因型AAAaaa合计初始p22pqq21适合度1-s1-s1选择后p2(1-s)2pq(1-s)q21-s(1-q2)第35页,共67页，星期六，2024年，5月**（四）淘汰部分显性，随机交配选择后下一代的隐性基因频率第36页,共67页，星期六，2024年，5月**(五)突变和选择两者的平衡状态突变：对隐性个体做不完全选择时：aAu????v当突变与选择的变化量相等时：v=0当q很小时：第24幻灯第37页,共67页，星期六，2024年，5月**四、遗传漂变定义１：由于抽样误差基因频率的随机波动。遗传漂变在任何群体中都存在，但在小群体其效应最明显。定义２：基因频率的随机变化。这种变化在任何群体都会发生，并且不可逆转。定义３：由某一代基因库中抽样形成下一代个体的配子时所发生的机误，这种机误引起基因频率的变化。定义４：对固定群体大小来说，对配子的随机抽样引起基因频率的变化第38页,共67页，星期六，2024年，5月**四、遗传漂变Wright－Fisher模型：假定群体大小为N，没有世代重叠，每世代从亲本群体抽取2N个配子。Y(n)表示第n世代A1型配子的数量，在没有突变和选择的情况下，p=i/2N，则第n+1世代A1配子有j个的概率为：第39页,共67页，星期六，2024年，5月**四、遗传漂变第40页,共67页，星期六，2024年，5月**五、非随机交配：概念同型交配：相同基因型异型交配：不同基因型同质交配：相同或相似表型异质交配：表型差异较大第41页,共67页，星期六，2024年，5月**五、非随机交配：效应同型交配：纯合子：基因型和基因频率都不变杂合子：基因频率不变，基因型频率改变；每一世代杂合子频率减少一半同质交配：实际上是不完全的同型交配异型交配：增加杂合子频率；不改变基因频率第42页,共67页，星期六，2024年，5月**第四节遗传多样性GeneticDiversity第43页,共67页，星期六，2024年，5月**定义多态性(Diversity):生态学中指某一特定生态单位物种的数量遗传多样性，广义：种内遗传变异大小分子、细胞、个体三个水平遗传多样性，狭义：种内遗传变异大小群体间和群体间第44页,共67页，星期六，2024年，5月*