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Chapter2EnzymesReducedDsbAfromE.coliLysozyme11/19/20241Enzyme
§2.1IntroductionDefinitionHistoryBüchner,1897:AbreakthroughinEnzymology.Catalystsatworkinalivingorganismcouldalsofunctioncompletelyindependentlyofanylifeprocess.EffortstoisolateandpurifyindividualenzymeswereBüchner’sdiscoveries.Sumner,1926:Firstisolationofapureenzyme.Enzymesareusuallyproteinsofhighmolecularweight(15,000MWseveralmillionDaltons)thatactascatalysts.11/19/20242Enzyme
CharacteristicsThree-dimensionalstructureofthefoldedprotein,determinedbythesequenceoftheaminoacids.Fragile:mildtemperature,pressure,pH,ionstrength(ambientconditions).Lowertheactivationenergyofthereaction,butDoesn’taffectFree-energychangeEquilibriumconstant11/19/20243Enzyme
Example:Thedecompositionofhydrogenperoxide(H2O2):18kcal/molUncatalyzedreactionat20℃ColloidalplatinumChemicallycatalyzedHydrogenperoxidaseEnzymaticallycatalyzed13kcal/mol7kcal/molFromArrheniusequation:Wehave,11/19/20244Enzyme
Theinteractionbetweentheenzymeanditssubstrate——weakforce:vanderWaalsforcesHydrogenbondingSpecific:CatalyzeonekindofreactionInvolvingcertainsubstratesNeedforcofactorsorcoenzyme:Cofactors:metalions:Mg,Zn,Mn,FeCoenzyme:acomplexorganicmolecule:NAD,FAD,CoA,somevitamins11/19/20245Enzyme
Enzymesarenamedbyaddingthesuffix–asetothe:EndofthesubstrateSuchasureaseThereactioncatalyzedSuchasalcoholdehydrogenaseNomenclatureEnzymesusingfamiliarnames:PepsininthedigestivetractTrypsininthedigestivetractRenninusedincheesemaking“Oldyellow”,whichcausedbrowningofslicedapples11/19/20246Enzyme
EC(EnzymeCommission)SIXclassesnumberedinFOURdigitsClassificationThefirstdigitalTheseconddigitalThethirddigitalThefourthdigitalTypeofreactioncatalyzed——mainclasses——actualsubstance11/19/20247Enzyme
OxidoreductasesFirstdigit1––theclassoxidoreductases.Seconddigit––the
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