基于TARGET转录组数据的儿童肾母细胞瘤生存分析与决策支持论文设计.pdfVIP

摘要

儿童肾母细胞瘤是胚胎性的恶性肿瘤，发病主要集中在儿童，是儿童排在第

二位的腹部恶性肿瘤。目前一般的治疗方式是手术结合放、化疗，但是总体预后

不佳，需对其分子机制开展进一步的研究。

本论文利用生物信息学和数据分析挖掘技术，针对TARGET数据库中儿童

肾母细胞瘤转录组数据和临床数据，在差异分析的基础上，构建基于随机分组得

到的训练集，使用单因素Cox回归模型将肾母细胞瘤患者的总体生存水平和

lncRNA的基因表达水平计算出来，再基于单因素Cox回归的计算结果分析出基

因表达显著的lncRNA进行多因素Cox回归模型构建。其中，在多因素Cox回

归分析中，我们再进一步选取更小的若个lncRNA，并将这些lncRNA的风险分

数估计值记录下来用于构建可以计算每个病人生存风险评分的公式。为了进一步

验证所筛选的lncRNA的预后分析能力是否独立于其他临床变量如年龄、性别、

癌症的分期等等指标，分别用多因素Cox回归分析和分层分析加以验证。通过

实验所构建的模型能帮助医生在临床医学诊断方面起到决策支持的作用。

关键字：肾母细胞瘤；差异表达分析；生存分析；Cox回归分析

I

Abstract

Kidneyblastomainchildrenisanembryonicmalignanttumor.Itsincidenceis

mainlyconcentratedinchildren,anditisthesecondmostcommonabdominal

malignanttumorinchildren.Atpresent,thegeneraltreatmentmethodissurgery

combinedwithradiotherapyandchemotherapy,buttheoverallprognosisispoor,and

furtherresearchonitsmolecularmechanismisneeded.

attranscriptomedataandclinicaldataofchildhoodnephroblastomainTARGET

werecalculatedusingunivariateCoxregressionmodel,andthenbasedonsingle

gene.ThecalculationresultsofplainCoxregressionanalysisshowedthatlncRNAs

withsignificantgeneexpressionwereconstructedbymultivariateCoxregression

model.InthemultivariateCoxregressionanalysis,wefurtherselectedsmaller

lncRNAsandrecordedtheriskscoreestimatesoftheselncRNAsforconstructinga

formulathatcancalculatethesurvivalriskscoreofeachpatient.Inordertofurther

ofotherclinicalvariablessuchasage,sex,cancerstageandotherindicators,

multivariateCoxregressionanalysisandstratifiedanalysiswereusedtoverify.The

modelconstructedthroughtheexperimentcanhelpdoctorsplayadecisionsupport

roleinclinicalmedicaldiagnosis.

Keywords：

regressionanalysis

II