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同步辐射与生命组织结构研究
同步辐射是指由同步加速器产生的高速运动电子在做曲线运动时,因
外加磁场作用于电子运动轨迹的切线方向而产生的电磁辐射。其光谱波段
覆盖从远红外到硬X射线的范围。同步辐射装置属于大科学设施,目前全
世界大约有70个左右,主要提供高品质的X射线。X射线与物质作用可
发生散射/衍射、吸收/透射、光电作用等现象。由于同步辐射X射线具有
亮度高、空间相干性好、光谱连续可调等特点,因而基于同步辐射的X射
线晶体衍射/相干衍射、X射线小角散射、x射线影像(吸收、相衬成像/
显微断层扫描)、X射线光谱学等方法及应用获得了长足的发展,为越来
越多的科学研究提供了重要的技术支撑。
在生命科学中,生命组织是分层次的。从分子、细胞、组织、器官,
进而个体、种群,“结构与功能”这一主题贯穿于各个层次。在微观层面,
同步辐射X射线晶体学已经是蛋白质结构生物学研究中不可或缺的主要方
法,而X射线相干衍射成像便于为观察细胞、病毒进行有益的探索。在宏
观层面,以同步辐射显微CT为代表的同步辐射影像技术,展示了若干脏
器的内部三维解剖结构和重要生理活动过程,而对化石物种精细解剖结构
的揭示又为物种起源与演化提供了关键证据。本文对相关进展作一简略。
在微观层次结构与功能研究中的应用
蛋白质、核酸等是实现生命活动的基本生物大分子,细胞是绝大多数
生物的基本功能单位。同步辐射X射线晶体衍射和X射线小角散射
(small-angleX-rayscattering,SAXS)是认识生物大分子结构之重要方
法:前者提供原子坐标下的蛋白质分子三维结构,揭示原子分辨率水平的
蛋白质分子中各结构域、蛋白质复合物或蛋白质靶点与药物小分子相互作
用的细节:通过SAXS可观察溶液里生物大分子构象的变化,如蛋白质的
组装、折叠等动态过程。而在细胞学研究中,X射线相干衍射成像等可能
是对现有方法之有益补充。
利用我国唯一的第三代同步辐射大科学装置——上海光源。我国科学
家自2022年5月以来解析的蛋白质晶体结构数已超过1000个,有30多
篇论文发表在国际上的《自然》《科学》和《细胞》期刊上。例如,禽流
感病毒外壳的血凝素蛋白介导了宿主识别,其进化与变异是导致禽流感病
毒跨宿主传播之主要原因,Q226L氨基酸突变可导致宿主识别的转变。
2022年2月我国暴发禽流感,我国科研人员对分离获得的H7N9高致病性
禽流感病毒安徽株和上海株血凝素蛋白及其突变体分别进行了禽源、人源
受体的复合蛋白质结构研究。结果显示。除Q226L氨基酸突变外还有其他
多个氨基酸参与安徽毒株的人源受体结合能力,这种能力可能是其普遍性
人际传播流行的重要原因之一。
蛋白质晶体学研究要求实验材料必须是晶体;非晶体样品的衍射图样
是连续微弱的衍射信号,而不是离散布拉格衍射点,因此X射线晶体学不
再适用。但基于对布拉格衍射峰之间信号过采样原理发展起来的x射线相
干衍射成像(coherentdiffractionimaging,CDI),可实现对非晶体样
品几十纳米分辨率的成像。利用CDI方法,研究人员已获得22纳米分辨
率的鼠疱疹病毒的电子密度图像、50纳米分辨率的酵母细胞的三维结构
等。根据不同电子密度可清晰复原单个酵母内部细胞核、线粒体、液泡等
细胞器。这对现有光学成像(如激光共聚焦显微镜)在z轴方向上分辨率
较低导致单个细胞三维影像失真的现象是有益的补充。
在生物医学研究中的应用
临床上,计算机x射线断层扫描(CT)、磁共振成像(MRI)和正电
子扫描(PET)成像等已广泛用于常规诊断:而基础研究中实验动物的空
间尺寸和生理参数与人体有很大差异(如小鼠平均心跳频率约为600次/
分,平均呼吸频率160次/分,分别是人对应频率的8-10倍),已不是临
床影像学的简单延伸可以满足。以同步辐射显微CT
(synchrotronradiationmicrotomography,SR-uCT)为代表的同步辐射
影像具高时空分辨的特点。由于同步辐射X射线光子通量高于普通X射线
2-3个数量级,大大降低了单次曝光时间,因而提高了帧频,实现了快速
动态成像(现在对2048x2048像素大小的图像可做到几十赫的采样频率);
其空间分辨率在微米-亚微米级,远优于MRI。同步辐射X射线不但可进
行高品质吸收成像,也可很好地实现相衬成像。x射线穿过
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