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（农业畜牧行业）荞麦内转
录间隔区(ITS)的扩增及序
列分析四川农业大学
荞麦内转录间隔区（ITS）的扩增及序列分析
生物科学2002级曾子贤
指导老师吴琦副教授
摘要：本研究以野生金荞麦、栽培苦荞为材料，采用改进的CTAB法提取荞麦总
DNA。设计壹对特异性引物，对三份荞麦ITS区序列进行PCR扩增，均获得长约
700bp的单壹条带。PCR产物测序结果表明，野生金荞麦1号测序片段为699bp，
包含ITS区序列为660bp；野生金荞麦2号测序片段为678bp，包含ITS序列为
646bp；苦荞测序片段为640bp，包括ITS序列为599bp。将所得到的三份荞麦ITS
区序列分别和GenBank中登录的荞麦ITS序列进行比较。结果表明，野生金荞麦
1号和已知金荞麦ITS区同源率为90.8%，野生金荞麦2号和已知的金荞麦ITS
区序列同源率达到91.6%。供试苦荞和已知苦荞ITS区同源率为99.8%。
关键词：野生金荞麦；苦荞；内转录间隔区（ITS）序列；5.8SrDNA；PCR；序列
分析
AmplificationandSequencesanalysisofInternal
TranscribedSpacerofBuckwheat
ZENGZi-xianBiologicalScience,Grade2002
DirectedbyWUQi(AssociateProf.Ph.D)
Abstract：
WildnessF.cymosumandcultivatedF.tataricumwereinvestigatedinthisarticl
e.BytheimprovingmethodofCTABDNAextraction,totalDNAfromthreebuckwheatw
asobtained.Apairofspecificprimerswasdesigned.TheITSregionsofthreebuck
wheatwereamplified.Theamplifiedfragments,about700bpinlength,wereseque
nceddirectly.Theresultsshowthatthesequencingfragmentsare699bp,678bpan
d640bpinlength,includingITSregionsofF.cymosumandF.tataricumare660bp,6
46bpand599bpinlength.ComparingF.cymosumandF.tataricumwithsequencesrep
orted,itsuggeststhatthehomologyrateofITSsequenceofF.cymosum,NO.1is91.
6%andNO.2is90.8%andthehomologyrateoftheITSsequenceofF.tararicumis99.8
%.
Keywords:WildnessF.cymosum;F.tataricum;ITSsequences;5.8SrDNA;Sequence
Analysis
荞麦属于蓼科（Polygonaceae）荞麦属（FagopyrumMill）植物。荞麦不仅
是营养丰富的粮食作物，也是有较好药用价值的药用植物。因此开展荞麦属植物
的系统发育和分子进化研究，进壹步完善荞麦属植物的分类和新种、野生种的鉴
定，对丰富的荞麦遗传资源保护和利用以及荞麦属植物的开发和改良提供系统学
资料。
KweonHeo等[1]对荞麦属的野生种进行了分类，将其划分为3大类（表1）。
表1荞麦属的分类
第1类F.esculentumF.homotropicumF.esculentum.Ancestralis
第2类F.cymosumF.tataricumF.tataricum.potanini
F.callianthum
F.capillatum
F.lineare
第3类
F.macrocarpum
F.gilesii
F.pleioramosum
F.rubifolium
F.statice
F.gracilipes
F.leptopodum
F.urophyllum
近年来，分子生物学研究技术如RFLP分析、AFLP分析、SSR分析、RAPD分析、
DNA序列分析为分子系统学的研究提供了重要的分子标记资料。其中核糖体DNA内
转录间隔区（ITS）序列分析已被广泛的用于植物属内、近缘属间的系统发育分
析[2]。对于荞麦种间亲缘关系，国际上多从传统的形态学、种间可杂交性、同功
酶、cpDNA、rDNA、rbcL、acc
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