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;;热点;;;题型一限制酶的选择技巧
(1)根据目的基因两端的限制酶切割位点选择限制酶;(2)根据质粒的特点选择限制酶(如图);[例1](2024·巴蜀中学适应考)科学家从大量木乃伊中获得少量木乃伊DNA,进行克隆,复制了2400年前的DNA。某生物兴趣小组同学模拟了其中部分研究过程,设计了如下实验(MspⅠ、BamHⅠ、MboⅠ、SmaⅠ为4种限制性内切核酸酶,它们识别的碱基序列和酶切位点分别为C↓CGG、G↓GATCC、↓GATC、CCC↓GGG)。请回答以下问题:;(1)从解旋过程进行分析,PCR扩增木乃伊基因与体内DNA复制过程不相同的地方是_______________________________________________________________
________________________________________________________(答出两点)。
(2)若将图乙中质粒和图甲中木乃伊基因通过同种限制酶处理后,构建重组质粒,应选用的限制酶是________,选择理由是_______________________________
___________________________________________________________________。;(3)经检测,部分含有重组质粒的大肠杆菌菌株中目的基因不能正确表达,最可能的原因是__________________________________________________________。
(4)据图丙分析,培养基除了含有细菌生长繁殖必需的成分外,培养基A、B还应分别含有______________。从检测筛选的结果分析,含有目的基因的是___________菌落中的细菌。;解析(1)PCR扩增是完全解旋后进行复制,在高温条件下解旋,不需要解旋酶,而体内DNA复制是边解旋边复制,需要解旋酶解旋。(2)能够获取目的基因并切开质粒的限制酶有识别序列为G↓GATCC的BamHⅠ和识别序列为↓GATC的MboⅠ,若使用MboⅠ会同时破坏质粒中的青霉素抗性基因和四环素抗性基因,所以要用BamHⅠ来切割目的基因和质粒,切割后保留了完整的青霉素抗性基因,便于筛选出含有重组质粒的大肠杆菌。(3)因为目的基因和载体是用同种限制酶切割的,同种限制酶切割形成的末端相同,部分目的基因与质粒反向连接,导致目的基因不能正确表达。;(4)用限制酶BamHⅠ对质粒进行切割时,会破坏四环素抗性基因,但不会破坏青霉素抗性基因,因此导入重组质粒的大肠杆菌能在含有青霉素的培养基上生存,但不能在含有四环素的培养基上生存。所以图丙培养基A和培养基B还应分别含有青霉素、四环素。从检测筛选的结果分析,培养基A中含有菌落4和6,培养基B中不含菌落4和6,故含目的基因的是4和6菌落中的细菌。;题型二PCR中引物的设计与选择
利用PCR扩增目的基因(如干扰素基因)时,设计引物序列的主要依据是有一段已知目的基因(干扰素基因)的核苷酸序列。所以引物是一小段能与DNA母链的一段碱基序列互补配对的短单链核酸。
(1)引物的作用:TaqDNA聚合酶不能从头开始合成DNA,只能从3′端延伸DNA链。当引物与DNA母链通过碱基互补配对结合后,TaqDNA聚合酶就能从引物的3′端开始延伸DNA链。不同引物可结合不同的目的基因并进行扩增。;(2)设计引物应遵循的主要原则
①引物长度应大于16个核苷酸,可防止随机结合。
②引物与靶序列间的Tm(指当50%的引物和靶序列表现为双链DNA分子时的温度)不应过低。
③引物不应有发夹结构,即不能有4bp以上的回文序列。
④2个引物间不应有4bp以上的互补序列或同源序列。
⑤引物中碱基的分布应尽可能均匀,G+C含量接近50%。;(3)引物的处理
由于引物延伸从3′端开始,3′端不能进行任何修饰,引物5′端对扩增特异性影响不大,因此,可给予修饰而不影响扩增特异性。引物5′端修饰包括加酶切位点、标记生物素、荧光等。为了使经PCR扩增的目的基因能与载体正常结合,需要在2种引物的5′端添加不同的限制酶的识别序列。其目的是保证目的基因定向插入载体并避免目的基因自身环化。;(4)PCR循环时与引物相关的计算
PCR经过n次循环产生的DNA数为2n,一共有2n+1条链,其中有2条链是DNA母链,不含引物,其他的每1条链均含1个引物,并且2种引物的数量相等,故PCR过程经过n次循环,需要的引物总个数是2n+1-2,需要某一种引物的总个数是(2n+1-2)×(1/2)=2n-1。一个DNA由1条母链和第1种引物延伸的子链组成,另一个DNA由另1条母链和第2种引物延伸的子链组成,其他的DNA均由2种引物延伸的2条子链组成。;[例2](202
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