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AAV的包装纯化浓缩方法总结.docx

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AAV的包装纯化浓缩方法总结

腺相关病毒(adeno-associatedvirus,AAV),也称腺伴随病毒,属于微小病毒科依赖病毒属,是目前发现的一类结构简单的单链DNA缺陷型病毒,需要辅助病毒(通常为腺病毒)参与复制。它编码两个末端的反向重复序列(ITR)中的cap和rep基因。ITRs对于病毒的复制和包装具有决定性作用。cap基因编码病毒衣壳蛋白,?rep基因参与病毒的复制和整合。AAV能感染多种细胞。rep基因产物存在时,病毒DNA很容易整合到人类第19号染色体。

重组腺相关病毒载体(rAAV)?源于非致病的野生型腺相关病毒,由于其安全性好、宿主细胞范围广(分裂和非分裂细胞)、免疫源性低,在体内表达外源基因时间长等特点,被视为有前途的基因转移载体之一,在世界范围内的基因治疗和疫苗研究中得到广泛应用。经过10余年的研究,重组腺相关病毒的生物学特性己被深入了解,尤其是其在各种细胞、组织和体内实验中的应用效果方面已经积累了许多资料。在医学研究中,rAAV被用于多种疾病的基因治疗的研究(包括体内、体外实验);同时作为一种有特点的基因转移载体,还广泛用于基因功能研究、构建疾病模型、制备基因敲除鼠等方面。

实验步骤

1、准备HEK293T细胞:

提前一天分HEK293T细胞,包装时细胞密度85%-90%且细胞分布均匀,状态良好(即:显微镜下观察,培养基中无杂质,无细胞悬浮或有少量细胞悬浮,细胞饱满,在培养皿中贴壁均匀)。

2、包装病毒

1)提前一到两个小时给细胞换液,换成无血清的DMEM培养基(1%HEPES和1%P/S)。换液时移液管要靠近培养皿内壁但不要贴住培养皿内壁缓慢加入DMEM,防止将已经贴壁的细胞吹起,同时换液时应注意避免移液管污染换液用培养基及细胞。

2)转染:以5个15cm培养皿的量为例:

向15ml离心管中依次加入DMEM:9ml,Helper:124μg,RC:76μg,目的质粒:65.1μg,PEI:1ml,振荡混匀后室温静置30min。

辅助质粒和目的质粒需要根据其浓度换算出所需的体积,在加入之前要振荡混匀。

3)将上述静置后的液体平均加到5盘HEK293T细胞中并做好标记,加入时同样要贴壁缓慢加入,避免将细胞吹起,加入后摇晃混匀(水平十字混匀)。将细胞至于37℃,5%CO2培养箱中培养。

4)观察转染效率:

转染后24h观察转染效率,一般为60%-70%左右,看看所需荧光是否正确。

3、收毒

1)将细胞吹起,连同培养基一并收到50ml离心管中,每5盘细胞收集到3个50ml离心管中,平均每管45ml,3500rpm(2100g)常温离心7min。

2)将培养基上清转移到新管中,PEG8000沉淀过夜(每100mL加入2.33gNaCl+8.5gPEG8000),第二天离心3500g、4℃离心30min,弃掉上清(离心后马上弃去上清,防止病毒回溶),用2mlPBS+0.001%PF68?重悬。

3)将细胞沉淀用PBS+0.001%PF685ml重悬,冻融一次后加入5MNacl?(高压灭菌)2ml,涡旋混匀。

4)将2)的重悬液与3)的重悬液混合,振荡混匀后超声至不粘稠,超声时不同样品之间探头要依次经过84(用无菌水稀释10倍),75%酒精,灭菌水的清洗,超声30s停8~10s,根据样品的粘稠度不同AMPL30%超3-4次,AMPL20%超一次(用粗的探头)。转换超声强度是因为当用AMPL30%超声3-4次不粘稠后,如果再用30%的强度超声一次可能会因强度过强对病毒活性有一定的影响,换用20%AMPL?超声一次可以使超声更加充分。

5)将超声后的液体3500g、4℃?离心30min,将上清转移至新的离心管中。

4、纯化:碘克沙醇密度梯度离心

1)按如下的比例配置不同浓度的碘克沙醇。(用灭菌水配制60%碘克沙醇w/v,并用0.2μm的滤膜过滤至灭过菌的瓶中)

层数

60%碘克沙醇(ml)

5MNacl

(ml)

H2O

(ml)

2.5MKCl

(μl)

1MMgCl2

(μl)

10×PBS

(ml)

Total

(ml)

每管用量(ml)

15%

25

20

45

100

100

10

100

9

25%

41.7

0

48.3

100

100

10

100

6

40%

66.7

0

23.3

100

100

10

100

5

60%

100

0

0

100

100

0

100

4.2

?

?

?

?

?

?

?

?

?

?

2)取一个超离管(超离管和盖子均高压灭菌后使用),逐层加入不同浓度的碘克沙醇。先加入60%层4.2ml,再加入40%层5ml,其次加入25%层6ml,后加入15%层9ml。加入不同浓度的碘克沙醇时要倾斜离心管并缓慢推入,避

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