源代码feature agglomeration特征融合算法介绍及python实现方法-peaker.pdfVIP

源代码feature agglomeration特征融合算法介绍及python实现方法-peaker.pdf

  1. 1、本文档共3页,可阅读全部内容。
  2. 2、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
  3. 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载
  4. 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
  5. 5、该文档为VIP文档,如果想要下载,成为VIP会员后,下载免费。
  6. 6、成为VIP后,下载本文档将扣除1次下载权益。下载后,不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们
  7. 7、成为VIP后,您将拥有八大权益,权益包括:VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
  8. 8、VIP文档为合作方或网友上传,每下载1次, 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等,对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多

#源代码#Featureagglomeration特征融合算法介绍及python实现方法

Peaker

对于海量特征的大数据,我们往往需要对特征进行进一步的优化

筛选,例如特征提取,特征选择,以及其他降维的方法,如PCA。主成

分分析PCA是我们比较熟悉的一种将维方法,主要是在特征中识别出

最大主成分的矢量方向,通常是可以解释85%的数据信息,那么我们

就用这几个主成分来代表其他特征。而今天我们要介绍另一种降维方

法——Featureagglomeration。Featureagglomeration的主要思想是评估

之间的相似性,类似于层次分析的原理,将具有相似性的特征归

为一个聚类,从而实现降维。

今天我们介绍一下如何通过python语言实现Feature

agglomeration。首先我们创建一组数据集,由1797个数据点构成,包

括64个特征,我们对这些特征进行特征融合。由于特征融合的算

法于层次聚类,所以这里不难理解,我们要从聚类的cluster包调

用Featureagglomeration函数。如下所示

从上面结果可以看出,我们调用cluster包里的FeatureAgglomeration函

数,计算特征之间的相似性,并形成聚类,最后将64个特征融合为32

个特征,实现了降维的目的。

接下来我们实战一下,利用一组图形数据,我们尝试将相似的特

征进行融合,看看融合后的数据模式是什么样。结果如下

实现代码如下:

接下来我们比较两种降维的策略

1.单变量特征选择(Anova)

2.特征融合Wardhierarchicalclustering

我们以BayesianRidge作为有监督的分类器模型,比较的结果如

第一张图为真实的特征权重,第二张图为Anova法单变量特征选

择的结果,第三张图为特征融合算法。从图中可以看出,原始的特

征点被基于相似性聚成多个类,用不同颜色划分区域。

Python下实现的代码地址

喜欢本文吗?欢迎加入云生信跟大家一起进步

~

文档评论(0)

cra12138 + 关注
实名认证
文档贡献者

该用户很懒,什么也没介绍

1亿VIP精品文档

相关文档