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其身正,不令而行;其身不正,虽令不从。——《论语》
聚丙烯酰胺凝胶电泳比一般电泳的分辨率高
的原因
聚丙烯酰胺凝胶电泳(PolyacrylamideGelElectrophoresis,
简称PAGE)是一种常见的电泳技术,其原理是将样品通过电场作用在
聚丙烯酰胺凝胶(PolyacrylamideGel)中移动,根据样品的电荷、
大小和形状等特征,将其分离出来,并通过染色或检测的手段进行鉴
定和分析。相比于其他电泳技术,PAGE具有分辨率高、分离效果好、
样品载量大、操作简便等特点,在生物医学等领域得到广泛应用。本
文将从聚丙烯酰胺凝胶、电荷与大小、形状特征等方面,探讨PAGE分
辨率高的原因。
一、聚丙烯酰胺凝胶的特性
PAGE中的聚丙烯酰胺凝胶是一种类似于塑料的聚合物材料,它的
组成是由丙烯酰胺、N,N-甲撑双丙烯酰胺(Bis)、离子型表面活性
剂(SDS)等在合适催化剂的作用下在聚合反应中形成的。聚丙烯酰胺
凝胶的重要特点是其孔隙度可控,即可以根据不同的研究需要调整聚
其身正,不令而行;其身不正,虽令不从。——《论语》
合物的组成以控制孔隙的大小和分布,从而实现对样品分离的精确控
制。例如,用低浓度的丙烯酰胺和Bis聚合,所得的凝胶孔径较大,
分离范围和移动速度较快,适用于较大分子质量分析;而用高浓度的
丙烯酰胺和Bis聚合,所得的凝胶孔径较小,分离范围和移动速度较
慢,适合于较小分子质量分析。因而,PAGE凝胶的管柱对产生最佳的
分辨效果显得至关重要。
二、电荷与大小特征
在PAGE中,样品被施加电场后,在凝胶中的运动速度与分子的电
荷量成正比,即带负电的分子在负电场下向阳极运动,反之则向阴极
运动。因此,分子的电荷量不仅决定了它们在PAGE中的运动速度,还
决定了分子之间的相互作用。具有类似电荷的分子会互相排斥,不同
电荷的分子则会吸引,这些相互作用会导致分子在PAGE中的峰形成,
并影响着其分离程度。PAGE可以通过调整环境离子浓度和pH值来影响
样品的电荷状态,从而调节分子之间的相互作用。通常情况下,PAGE
条件下维持bufferpH=8.3或8.8,使得异电型蛋白质由于受到SDS的
变性作用后,所带的大量负电荷呈现在PAGE中一致负电,从而使其在
其身正,不令而行;其身不正,虽令不从。——《论语》
PAGE中按分子质量和形状大致得到分离。非变性状的蛋白质,则需在
PAGE前进行特定pH区间电泳,分离根据分子的电荷性质。
三、形状特征
PAGE对分子的分离和分辨还和分子的形状特征有关。不同分子的
形状存在巨大差异,例如线性分子和球形分子的动力学表现就有很大
不同。对于线性分子而言,它们在PAGE凝胶孔中更易穿过,所以迁移
更快,而对于球形分子,它们在凝胶孔中会受到更大的阻力,迁移速
率较慢。PAGE也可以通过制作不同大小的凝胶孔隙来调节溶液流速,
分析复合机构或者多聚物的大小,避免多聚物形成的解离和多聚物的
识别,更好地利用另一种下机技术,如图谱肽图谱。同时,在采用非
变性状的PAGE时,线形蛋白质的特点可以被利用,例如在蛋白质结构
研究中,可以对其长短进行分析,有很好的应用前景。
综上所述,聚丙烯酰胺凝胶电泳比一般电泳的分辨率高的原因有
多方面,其中聚丙烯酰胺凝胶可以根据需求调整孔隙大小,从而控制
移动速度和分离范围,达
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