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石油学报(石油加工)
2010年8月ACTAPETROLEISINICA(PETROLEUMPROCESSINGSECTION)第26卷第4期
文章编号:1001-8719(2010)04-0547-04
PCR-DGGE技术用于石油污染土壤中微生物群落结构多样性的初步研究
吴伟林,张秀霞,单宝来,张剑杰,赵朝成
(中国石油大学环境科学与工程系,山东青岛266555)
摘要:采用现代分子生物学技术,结合传统的富集培养过程,直接从土壤中提取细菌总DNA和从培养基富集培养的菌体中提取总DNA,并对基因组总DNA中16SrDNAV3可变区进行聚合酶链式反应(PCR)扩增和变性梯度凝胶电泳(DGGE)测定,对油田某区块石油污染土样微生物群落和多样性进行初步研究。结果表明,年代较久的石油重度污染土壤菌群数量少于轻度污染土壤,经人工堆肥处理的土壤生物多样性明显优于未进行人工处理的污染土壤;经堆肥处理的土壤中微生物多样性在纵向上也存在差异,中层土微生物多样性明显,表层土最不明显;不同污染土壤中存在一定数量相同的优势菌群,但也表现了相当的差异性,经堆肥处理的污染土壤中微生物群落组成的相似性在纵向上也存在差异。
关键词:石油污染土壤;PCR-DGGE技术;传统培养分离方法;微生物多样性
中图分类号:X172;TE991文献标识码:Adoi:10.3969/j.issn.1001-8719.2010.04.010
PRIMARYSTUDYONTHEMICROBIALDIVERSITYINOILPOLLUTEDSOILSBYTHEMETHODOFPCR-DGGE
WUWeilin,ZHANGXiuxia,SHANBaolai,ZHANGJianjie,ZHAOChaocheng
(DepartmentofEnvironmentalScienceandEngineering,ChinaUniversityofPetroleum,Qingdao266555,China)
Abstract:Inordertostudythemicrobecommunityandthemicrobialdiversityofthebioremediationsoilfromsomeoilfield,themolecularbiologicaltechnologycombinedwithtraditionalcultured-based
onmicrobiologicalmethodwasusedtodirectlyextracttotalDNAfromoilpollutedsoilandextracttotalDNAfromculturemedia,whichwereamplifiedbyPCR,andseparatedbyDGGE.Theresultsshowedthatthemicrobialcommunityquantityoftheheavilyoilpollutedsoilwaslessthanthatoflow-gradeoilpollutedsoil,andthemicrobialdiversityofthebioremediationsoilwasmoresignificantthanthatoftheun-bioremediationsoil.Themicrobialdiversitywasdifferentalongtheverticaldirectionofthebioremediationsoil,thatis,themicrobialdiversityofmiddlesoilwasmostsignificantandthemicrobialdiversityofthesurfacesoilwastheleastsignificantamongthethreelayersofthesoil.Thereweresomemicrobecommunitywithsamequantityindifferentpoll
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